胡适任职到1948年12月15日北平和平解放前夕，搭国民党政府专机逃往南京。1949年2月北平解放，文学院院长汤用彤（先后任中央研究院院士、中国科学院学部委员）出任北大校务委员会主席。
中华人民共和国成立后，当时胡适还在美国办外交，人民政府接管了北京大学。1951年6月，著名学者马寅初被任命为新中国第一任北大校长。
学者谢泳认为：马寅初是新政权建立后首任北大校长，但他和政府之间已没有往日的平等地位，只有屈从，没有独立。中国大学校长身上的独立性到马寅初这里就绝迹了，他是中国国立大学校长中最后一位在政府和校长之间显示了自由精神的人。
全国高校于1952年进行院系调整，清华大学、燕京大学的文理科部分师资并入北京大学，北京大学工学院机、电、土、建4系合并到清华大学，化工系合并到天津大学，农学院、医学院、地质系、政法专业等脱离北京大学，或组建成新的高等院校，或并入其他相关院校。北大自北京城内迁入燕园。
此后，北京大学成为一所以文理基础教学和研究为主的综合性大学，为国家培养了大批人才。据不完全统计，迄今北大校友和教师有近600位两院院士，中国人文社科界有影响的人士相当多也出自北大，并且产生了一批重大研究成果。
改革开放以来，北京大学进入了一个前所未有的大发展、大建设的新时期，并成为国家“211工程”、“985工程”重点建设的两所大学之一。
2000年4月3日，北京大学与原北京医科大学合并，组建了新的北京大学。原北京医科大学的前身是国立北京医学专科学校，创建于1912年10月26日。20世纪三、四十年代，学校一度名为北平大学医学院，并于1946年7月并入北京大学。1952年在全国高校院系调整中，北京大学医学院脱离北京大学，独立为北京医学院，后改名北京医科大学，1985年成为国家首批“211工程”重点支持的医科大学。
近年来，北京大学大力推进教学改革，按照“加强基础，淡化专业，因材施教，分流培养”的方针，修订了教学计划，加强了基础教学，充实、更新了教学内容，注重培养学生的创新能力和创造精神。在教学管理上，实行学分制，提高选修课比例，鼓励学生跨专业选课、修读辅修专业或第二学士学位，提前修满学分的学生可以提前毕业，并推荐品学兼优的应届毕业生免试攻读硕士、博士学位。
[附文1] 选择北大的10大理由
理由之一，北大是中国的最高学府
北京大学创立于1898年，抗日战争结束后，初名京师大学堂，是我国中央政府设立的第一所大学，为中国近代正式设大学之始，其成立标志着中国近现代高等教育的开端，由此开创了中国的现代学制。北大成立之初即为中国最高学府，也是当时中国的最高教育行政机关，行使国家教育部职能，统管全国教育事宜。北大传承着中华数千年国家最高学府——“太学”的学统，是中国古代最高学府在现代的延续，自建校以来一直享有崇高声誉。“上承太学正统，下立新学祖庭”，这是对北大地位的精确评价。时至今日，北大依然是全国实力最强的综合性大学，并朝着世界一流大学前进。
理由之二，北大是中国最具精神魅力和学府气质的大学
作为中国最具精神魅力的学府，一百余年来，这里成长着中国几代最优秀的学者，他们从这里眺望世界，走向未来，以坚毅的、顽强的、几乎是前仆后继的精神，在这片辽阔的国土上传播文明的种子。它不是一种物质的遗传，而是灵魂的塑造和远播。“思想自由、兼容并包”的传统在北大薪火相传，构成一种恒远而不具形的存在。“科学与民主”早已成为这圣地不朽的灵魂。在北大学会的不仅仅是单纯的知识，感受更多的却是北大对一个人人格的熏陶。从这片园子里面走出的人，都会深深打上北大的“烙印”，具备特殊的精神气质。
理由之三，北大是中国实力最强的综合性大学
北京大学不仅是中国最早的综合性大学，更是中国实力最强的综合性大学。北大理科、文科和医科的国家重点学科数均居全国第一（共81个，在各高校中遥遥领先）。工科非常有特色，能源与资源工程、石油地质、力学、测绘科学与技术、材料科学、景观设计与建筑学、环境工程、计算机科学与技术、电子科学与技术、航空航天研究、先进技术研究、跨学科研究等都在国内处于领先水平。自2002年以来，中国先后3次完成全部80个一级学科（军事学门类除外）的评估工作。北大共有33个一级学科参与评估，其中有11个排名第一，有29个排名前5名，居各高校之首。理、医、工、法、文、史、哲、经济、管理、教育等学科门类齐全、分布平衡、协调发展。同时，北大的一级学科博士点数量亦居全国高校之首。北大有着最强的综合学科实力和多元化的校园氛围，最适合人才成长。只有在北大这样的综合性大学，你才可能像其他北大人一样，轻松拥有那种诱人的资质。
理由之四，北大是中国理科最强的大学
北大是中国第一个建立理科的大学，我国第一个数学、物理、化学、计算机等专业皆诞生于此，有着最为悠久的历史和最深厚的积淀。北大理科的总体实力之强，全国其他高校无法望其项背。按照教育部最新评定的国家重点学科数目，无论是纯理科还是大理科（包括理工农医），北大均为全国第一，南京国民政府教育部在1945年9月4日指定胡适出任国立北京大学校长，而北大拥有最多的院士也同样证明了这一点。1946年7月才把校务交给胡适。北大的科研总体实力在全国高校中遥遥领先，目前全校共拥有各类研究所（中心）271个，国家级重点实验室12个，国家工程研究中心2个，教育部重点实验室14个，卫生部重点实验室和工程研究中心8个，国家基础人才培养基地17.5个，附属和教学医院18个。北大的声誉由一连串令人自豪的科学成就赢得：世界上第一例人工合成牛胰岛素有北大参与完成；世界上直径最小的单壁碳纳米管在北大产生；我国第一台百万次电子数字计算机在北大设计；锑、铕、铈原子量的国际标准在北大测定……凭借其浓厚的学术氛围和卓越的科研水平，北大能够不断地推陈出新，把最前沿的科学知识传授给学生。北大堪称我国科学的圣地。
理由之五，北大拥有国内最雄厚的师资力量
一流的大学最重要的是拥有一流的大师。而北大正可谓名师如林，目前拥有中国科学院院士52名，中国工程院院士7名，第三世界科学院院士11名，中科院院士数量在国内高校中高居第一。北大还拥有教育部“长江学者”75人；国家杰出青年基金获得者108人；国家“973项目”首席科学家15人；博士生导师逾1000人，上述指标均居全国高校第一。
理由之六，北大能给你最好的高等教育
北大为学生提供了得天独厚的学习条件。全校共拥有17.5个国家基础科学研究与教学人才培养基地，数量居国内高校之首。北京大学图书馆前身是始建于1898年的京师大学堂藏书楼，是中国近代第一所新型国立图书馆，现为亚洲高校最大图书馆，藏书已达703万册，并以每年8万册的速度递增。北大作为中国教育网华北地区网络中心，校园网以专线连接到每一间宿舍，同时北大也是中国第一所实现校园无线上网的高校，学生可以自由地在信息的海洋里遨游。北大一贯重视教学水平与质量，课程体系周密完备，重视学生素质的均衡发展。
理由之七，北大拥有中国最优秀的学生
北大是全国中学生心目中的圣殿，北大辉煌的历史、深厚的底蕴、最强的师资、综合的学科、最好的学术条件以及诱人的毕业去向，一直以来就吸引着全国最优秀的学子报考。北大是历年来录取各省市高考第一名最多的大学，历年来国际数学、物理、化学、生物奥林匹克竞赛获奖学生绝大部分都在北大深造。全国各省（直辖市、自治区）文理科前十名的学生中有近60%报考北大；同时国际奥赛奖牌得主几乎被北大囊括，数量一直位居各高校之首。北大在各地录取的总平均分，文科、理科、医学部均数一数二。同时，每年报考北大研究生的人数，一直以来为全国高校第一。
理由之八，北大是人才的摇篮，毕业去向良好
北大英才辈出，堪称大师之园。北大毕业生和教师为我国的自然科学、人文社会科学、医学、工程技术及国防事业、文化事业的发展做了奠基性和开拓性的贡献。这些北大师长们的杰出成就，激励着一代又一代青年学子们奋发图强。据不完全统计，在北大校友中已有586人当选院士（学部委员），总数雄踞全国高校之首。在23名“两弹一星”元勋中，北大校友就达12位。在北大学子中，不仅涌现了李政道、邓稼先、杨振宁、钱三强、于敏、郭永怀、朱光亚、周光召、唐敖庆、裴文中、黄汲清、刘东生等一大批科学巨匠，也出现了冯友兰、徐志摩、茅盾、朱自清、俞平伯、罗常培、张申府、顾颉刚、傅斯年、范文澜、冼星海等一大批饮誉海内外的文科大师。尤其值得庆贺的是，便委由傅斯年代理。傅把汪精卫政权时代全部教职员开除，12位国家最高科技奖中，就有6位获得者是北大（和西南联大）校友，他们是吴文俊、王选、黄昆、刘东生、叶笃正、吴征镒。北大人的身影活跃在各行各业之中。聪明的才智、坚实的培养、名牌的声誉、务实的风格……这些无不为北大人铺就了良好的出路。另外，北大学子每年出国的人数和学校的档次都同样高居全国之首，比如哈佛大学在中国招收的留学生名额大部分都投放给北大学子。
理由之九，北大是国际上知名度最高的中国大学
北大自创立以来，就一直是国际上知名度最高的中国大学，同时也是国内最具开放性的大学。置身于此，正可以放眼世界，胸怀天下。现有来自近百个国家的4000余名留学生在北大求学，留学生人数在全国高校中遥遥领先。历年来访问北大的诺贝尔奖获得者、国际学术大师、各国元首与政府首脑的人数，在国内高校中均居第一。目前，北大已与47个国家的219所著名大学建立了校际交流关系，数目亦居全国高校之首。
理由之十，未名湖畔是读书求学最理想的环境
北大校园又称燕园，包括淑春园、勺园、朗润园、镜春园、鸣鹤园、蔚秀园、畅春园、承泽园等，在明清两代是著名的皇家园林，数百年来，其基本格局与神韵依然存在。校园北与圆明园毗邻，西与颐和园相望。北大充分利用这一难得的历史遗产，营建了风景如画的校园环境，使之既有皇家园林的宏伟气度，又有江南山水的秀丽特色。这里不仅有亭台楼阁等古典建筑，而且山环水抱，湖泊相连，堤岛穿插，风景宜人；校园内古木参天，绿树成荫，四季常青，鸟语花香，园林景色步移景异。
优美典雅的环境内，充满着丰富多彩、魅力无穷的校园生活，使学生可以同时感受到自然的风景和浓厚的人文气息。美丽的湖光塔影伴随着大师的背影，这正是燕园中最美的图画。著名的“一塔湖图”，指的就是未名湖畔的景色。
从沙滩到燕园，从红楼到未名湖，百年北大伴随着风雨而前行。北大人那惊天动地的宏伟业绩与默默沉潜的学术思索，共同汇聚成一种可歌可泣的壮与美，凝铸一段梦魂牵绕的不灭的记忆。秉承着这圣地的精神魅力，每一位北大人都深深地懂得，于今日之北大与中国，“北大人”这个名字不仅昭示着一种荣耀，更提醒着一种责任。
[附文2]初进北大
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以下是茅盾回忆自己初进北大学习的情形：