二十二年春天闰月十九日，光武帝驾临长安，祭祀高庙，于是逐一祭祀十一陵。二月某一天，从长安回到京师。夏天五月三十日，发生日食。
秋七月，司隶校尉苏邺死于狱中。
秋九月，发生地震造成地裂。光武帝下诏说：“日前有地震，南阳尤为严重。大地，承受物体极重，所以静而不动。而今震裂，罪在君上。鬼神不顺从无德的人，灾祸降到吏民的头上，朕十分恐惧。令南阳不必交今年的田租和饲草。派遣谒者巡察。凡死罪囚犯在地震那天以前定罪的，减死罪一等，囚徒全都解去脚镣，穿上丝绵衣服。赐给郡中被压死的人以每人三千棺材钱。凡人头税和拖欠的田租而房屋损坏尤其严重的，不再收取。吏民死亡，或者还压在断垣毁屋下面，而家人羸弱不能收拾的，官府就出钱粮雇人，为他们寻找。”
冬天十月十九日，大司空朱浮被免职。二十日，光禄勋杜林为大司空。
这一年，齐王刘章死了，青州发生蝗灾。匈奴奥鞬日逐王比派遣使者到渔阳请求和亲，派中郎将李茂回报。乌桓击败匈奴，匈奴北迁，大漠以南空虚。诏命撤去边郡亭候的吏卒。
二十三年春正月，南郡蛮人造反，派武威将军刘尚征伐击败了他们，迁移蛮族人到江夏。
夏天五月八日，大司徒蔡茂死了。九月十三日，陈留太守玉况为大司徒。冬天十月九日，太仆张纯为大司空。高句丽率领族人到乐浪归附。
十二月，武陵蛮人造反，抢掠郡县，派刘尚去讨伐，交战于沅水，被打败了，刘尚战死。
这一年，匈奴奥鞬日逐王比率领部下并派使者到西河郡归附。
二十四年春天正月十九日，光武帝大赦天下。
匈奥鞬日逐王比率领部下并派遣使者到五原塞通好，请求替汉朝抵御北匈奴。
秋天七月，武陵蛮侵犯临沅，派遣谒者李嵩、中山太守马成讨伐蛮人，未能取胜，于是伏波将军马援率领四位将军去征伐。诏有关部门申明过去制定的阿附蕃王法。
冬天十月，匈奴奥鞬日逐王比自立为南单于，于是分裂为南、北匈奴。
二十五年春天正月，辽东境外貊人侵犯右北平、渔阳、上谷、太原，辽东太守祭肜招降了他们。乌桓首领来朝见光武帝。
南单于派遣使者到京都进贡，自称藩臣；又派他的左贤王打败北匈奴，开地一千余里。三月，南单于派子入侍。三十日，发生日食。伏波将军马援等击败武陵蛮人于临沅。冬天十月，反叛的蛮人全部投降。夫余王派遣使者进贡。这一年，乌桓首领率众内属，到京师朝贡。
二十六年春天正月，诏命有关部门增加百官的俸禄。千石以上，少于西汉旧制；六百石以下，多于旧俸禄。
光武帝初建寿陵。将作大匠窦融上书说园陵广袤，不必计较花费。光武帝说：“古时候帝王的葬具，都是陶俑瓦器，木车草马，让后世的人不知道墓室的所在。太宗懂得生死真谛，景帝能谨遵孝道，遭遇大乱的变故之后，而唯独霸陵有幸保全，岂不是美事吗！今所建墓地不许超过二三顷，不堆土为山陵，不修城池，只要不存水就可以了。”
光武帝派遣中郎将段彬授予南单于玺印绶带。命令他居云中，开始设置使匈奴中郎将一职，率兵保护南单于。南单于派儿子入侍，奉奏章来到京师。于是云中、五原、朔方、北地、定襄、雁门、上谷、代等八个郡的百姓回到了本土。光武帝派遣谒者分别带着弛刑徒修补整治城郭。发送尚在中原地区的边民，陆续返回各县，都赐给治装费，并转运粮食供给他们。
二十七年夏天，四月二十一日，大司徒玉况死了。
五月十一日，光武帝诏书说：“过去契担任司徒，禹担任司空，都没有‘大’字。命令二府去掉‘大’字。”又改大司马为太尉。骠骑大将军行大司马事的刘隆当天被罢免，以太仆赵熹为太尉，大司农冯勤为司徒。益州郡境外蛮夷率族人内属。北匈奴派遣使者到武威乞求和亲。
冬天，鲁王刘兴、齐王刘石开始前往封国。
二十八年，春天正月某一天，徒封鲁王刘兴为北海王，把鲁国加封给东海王。赐给东海王刘强虎贲武士、骑兵仪仗、以木架钟磬设礼乐。
夏天六月七日，沛国太后郭氏死了，光武帝于是下诏郡县捕捉王侯的宾客，受牵连而死的有数千人。
秋天八月十九日，东海王刘强、沛王刘辅、楚王刘英、济南王刘康、淮阳王刘延开始前往封国。
冬天十月十五日，光武帝诏命死罪囚徒都一律叫到蚕室受腐刑，女子受宫刑。北匈奴派遣使者进贡，乞求和亲。
二十九年春天二月初一，这一天发生日食。光武帝派遣使者清理冤狱，释放囚徒。四日，赐给天下男子以爵位，每人二级；赐给鳏夫、寡妇、孤儿、无子女的老人、有痼疾或残废的人，贫困不能自理的人以粮食，每人五斛。
夏天四月十日，光武帝诏命天下关押起来的殊死罪以下的囚犯直到一般的刑徒减去原罪一等，其余的罪可用钱财赎罪或罚劳役各有不同。
三十年春正月，鲜卑头领归属，入朝向光武帝庆贺。
二月，光武帝巡视东方。十三日，驾临鲁国，进而驾临济南。闰月十三日，车驾回到洛阳宫中。有彗星出现于紫宫星区。
夏天四月九日，光武帝徙封左翊王刘焉为中山王。五月，全国发生严重水灾。赐给天下男子以爵位，每人二级；赐给鳏夫、寡妇、孤儿、无子女的老人、有痼疾或残废的人、贫困不能自理的人以粮食，每人五斛。秋天七月某日，光武帝驾临鲁国。免除济阳县当年的徭役。冬天十一月某日，从鲁国回到京师。
三十一年夏天五月，全国发生严重水灾。
二十五日，赐给天下男子以爵位，每人二级；赐给鳏夫、寡妇、孤儿、无子女的老人、有痼疾或残废的人、贫困不能自理的人以粮食，每人六斛。三十日，出现日食。这年夏天，全国闹蝗灾。秋天九月三日，光武帝诏令死罪囚犯都一律募集到蚕室接受腐刑，女子接受宫刑。这一年，陈留下了谷子雨，形状像稗草籽。北匈奴派遣使者进贡。
中元元年春天正月，东海王刘强、沛王刘辅、楚王刘英、济南王刘康、淮阳王刘延、赵王刘盱都来朝见光武帝。二十八日，光武帝巡视东方。二月十日，驾临鲁国，进而驾临泰山。北海王刘兴、齐王刘石朝见光武帝于东岳。二十二日，焚柴望祭岱宗，登临泰山，聚土为坛而祭天；二十五日在梁父打扫干净场地而祭地。三月三十日，司空张纯死了。
夏天四月五日，光武帝车驾回到洛阳宫中。十一日，他大赦天下，免征羸、博、梁父、奉高等地的徭役，不交今年的田租和饲草。改年号为中元，并驾临长安。二十日，祭祀长陵。五月二十八日，从长安回到洛阳。
六月二十四日，太仆冯鲂为司空。二十八日，司徒冯勤死了。
这年夏天，京师发现有甘美的泉水涌出，喝了这泉水的人所有顽症都可以治愈，唯有盲人、跛人不能治。又有赤草长在水边。郡国频频报告发现甘露。
群臣上奏道：“地神显灵而朱草萌生。孝宣帝每有嘉瑞，就改年号，神爵、五凤、甘露、黄龙，都用来纪年，这是为了把感应送给天地神灵，表彰德信。因此化为升平，称作中兴。当今天下清平安宁，灵物不断降世。陛下心存谦虚退让，推辞而不愿自应瑞征，但是怎么可以让吉祥的符应和明显的喜庆湮没而无闻呢？应当命令太史把祥瑞记录编集起来，传给后世。”
光武帝不同意，他常常自己谦称无德，每当郡国上奏祥瑞，就压下而不接受，因此史官很少能记载下来。秋天，有三个郡国出现蝗灾。冬天十月六日，司隶校尉东莱人李为司徒。
十九日，派司空告祭高庙说：“高皇帝与群臣约定，非刘氏不封王。吕太后残害三个赵王，擅自封吕氏为王，仰仗社稷之灵，吕禄、吕产被诛除，天命几乎旁落他人，危急的朝廷重新安定。吕太后不应该配享高庙，与至尊同在祖庙。薄太后德行仁慈，孝文皇帝贤明治国，子孙仰赖他们的福荫，延续皇室至今。上薄太后尊号为高皇后，配享地神。迁吕太后庙主到园寝，四时上祭。”
十一月三十日，这一天有日食。这一年，初建明堂、灵台、辟雍，以及北郊兆域。光武帝宣布图谶于天下。免除济阳、南顿本年的徭役。参狼羌人侵犯武都，打败郡兵。陇西太守刘盱派兵援救武都，与武都郡兵一起讨伐反叛的羌人，全都打败了他们。
二年春天正月初八，光武帝开始建立北郊，祭祀后土。东夷倭奴国国王派来使者进贡。
二月五日，光武帝死于南宫前殿，享年六十二岁。遗诏说：“朕无益于百姓，全依照孝文皇帝制度，后事务必节省。刺史、二千石长吏都不要离开城池，不要派属吏或用邮传上书致哀。”
当初，武光帝久在军中，厌恶战争，而且知道天下疲惫不堪，盼望安定的生活。自从陇、蜀平定以后，不是紧急情况，未曾再谈论军事。皇太子曾经问起攻战的事情。光武帝说：“过去卫灵公问战法，孔子不回答，这种事不是你所该做的。”
他每天一大早就上朝，日头偏西才退朝。多次召见公卿、郎将讲论经书的道理，夜半时分才睡觉。皇太子见到光武帝勤劳不怠，找机会劝说道：“陛下拥有夏禹、商汤的贤明，而没有黄帝、老子休生养性的福气，希望能保养精神，优游自宁。”光武帝说：“我自己乐意这样，并不为此感到劳累。”虽然亲身建立大业，却兢兢业业好像能力不够一样，所以他能贤明慎重地对待国事，总揽大权，量时度力，所办的事没有什么过失。他辞退功臣而任用文官，收藏起弓箭而放马牛回归民间，虽然治国之道未能和古代圣贤的时候相比，这也算是配得上止息干戈的“武”字了。
刘秀平隗嚣
刘秀平定关东以后，为了彻底消灭割据势力，建立统一政权，发动了对盘踞西北的隗嚣的讨伐战争。隗嚣据天水、陇西、安定、北地四郡，直接威胁着关中。他鉴于开始失败后，所谓的“人心思汉”的观念已经改变，而代之以“上可为六国，下不失尉佗”的思想，想要与公孙述，窦融三足鼎立，这当然违背了刘秀的一统政策，刘秀开始以重爵予以拉拢，不成，则举大兵进行征服。
东汉建武六年（30）三月，光武帝刘秀向隗嚣下一诏书，内称要举大兵经过天水去伐蜀，主要是想以借道的名义，而深入隗嚣盘踞的腹地。刘秀一面派遣大将军耿弇、盖延等七将，兵约八万多人，从陇道西上；一面派来歙奉手书劝嚣降，真可谓兵威利诱，双管齐下。隗嚣见到来歙送来光武帝的手书，犹豫不决，当来歙督促他时，他就把来歙囚禁起来，而派大将王元率兵踞陇坻（在今陕西陇县西南），伐木阻塞道路以坚守。同年五月二十一日，光武帝亲自到长安，督率各路军马；耿弇等七将军，开始对陇坻的王元守军进行猛攻，结果被王元的反击打得大败。各军下陇山东退，王元在后紧追不舍，幸亏马武率军在后面拼力撕杀。杀死追兵数千人，汉军才得以东还。这是光武帝平定关东群雄以来所遭受的第一次大的失败。
汉军败于陇坻，全军东退，光武帝意识到隗嚣不会在短时间内被平定，同时又担心隗嚣军会乘胜追击，为了保守关中，命耿弇军守漆（今陕西邰县），冯异军守栒邑，祭遵军守（今陕西陇县南），吴汉率各军集中长安。当光武帝已作以上部署时，隗嚣果然乘胜分别派王元、行巡二员大将，率兵二万多人下陇，王元攻，行巡沿泾水东下攻栒邑，想从西北两个方向，进攻长安。行巡军快到栒邑时，冯异军潜往先行占据栒邑。祭遵也在击败王元。因此，关中的威胁被解除，而北地郡（今甘肃环县东南）的地方豪强，也纷纷叛嚣降汉，冯异遂乘胜进军义渠（今甘肃宁县西北），击破卢芳将军贾览，及匈奴奥鞬日逐王，北地上郡（今陕西绥德县东南五十里）、安定（今甘肃固原县）三郡遂都降汉，隗嚣仍退守陇山各个要隘。窦融此时也因而上书光武帝表示效忠，并写信劝隗嚣降汉，隗嚣不听，窦融就率各郡太守带兵入金城（今甘肃皋兰县西北黄河北岸），攻击隗嚣的联军先零羌、封何等，并把他们打得大败。窦融为了表示归汉的决心，杀死隗嚣的使臣张立，并解下隗嚣授予他的将军印绶，以示与隗嚣绝交。光武帝获得窦融坚决归汉的诚心与协助，形势大为有利，派马援从洛阳到长安，和他商议。遂一面派马援突骑五千，往来游说隗嚣大将高峻，任禹的下属及羌豪，陈明祸福，离间他们之间的关系；一面命马援给隗嚣的大将杨广写信，让杨广劝隗嚣归汉，进行攻心战。但光武帝的攻心战术，并没有收到成效，杨广对马援的信置之不理。旋即隗嚣又给光武帝写了一封言辞非常苛刻的信，光武帝不气馁，又让来歙（前面来歙被隗嚣囚禁，后设法逃归）到给隗嚣写信，保证能给隗嚣高官厚禄，并把嚣子入做人质，隗嚣仍不答应。至此，光武帝就暂时采取北连匈奴及卢芳的策略，伺机再对隗嚣发动攻击。隗嚣这时也派使臣到蜀，向公孙述称臣，与蜀连兵，共同抗拒光武帝。
东汉建武七年（31）三月，公孙述拜隗嚣为逆宁王，派兵往来声援隗嚣。同年秋，隗嚣自己率领主力步骑三万进攻安定，而别遣将攻打。当隗嚣的主力军沿泾水攻到阴盘（今陕西长武县西北）时，冯异率各军在此堵截，但北地、安定二郡已被隗嚣攻取。隗嚣派攻的军队也被祭遵阻截。于是光武帝刘秀也准备亲自率兵攻隗嚣，夺回北地安定二郡，解除对关中的威胁。刘秀先与窦融约好出兵的日期，准备对隗嚣实行东西夹击。但刚好遇雨道路隔断，隗嚣的军队也自动撤走，这个计划没有实施。光武帝就又遣来歙下降给王遵（隗嚣退军时，留王遵守泾川地区），王遵投降，遂被拜为太中大夫。而这时隗嚣仍占据陇山各要隘。