桑杰嘉措的政治错误主要有三个：第一，他隐匿了五世达赖喇嘛去世的消息，一瞒就是15年，而且此前康熙请他出兵攻打吴三桂的时候，他不但不积极响应，反而从中调和，从维护与清政府的关系方面考虑，造成了政治被动；第二，他联合准噶尔对付和硕特蒙古遗留在西藏的势力，这实际上是在延续五世达赖喇嘛生前的政治思路，但那个时代，局势是天天变的，此时的准噶尔首领是噶尔丹，他可是和清政府对着干的人物，联合他就等于得罪清政府；第三，在西藏内部，他还面临着和硕特蒙古当年留下来的势力，本来经过五世达赖喇嘛晚年的几次调整，这股势力已经逐渐弱化；但既得利益谁也不可能放弃，恰好此时和硕特蒙古出来个厉害角色，他就是固始汗的曾孙拉藏汗。这是个十分彪悍和狡猾的人，也正是他点燃了西藏地方事务内外矛盾的总导火索，也直接造成了仓央嘉措的悲剧命运。
1705年，拉藏汗和桑杰嘉措两方发生战争，桑杰嘉措被处死，拉藏汗掌握大权。此后，他就对仓央嘉措多方责难，并向清政府奏称由桑杰嘉措所拥立的仓央嘉措，并不是五世达赖喇嘛真正的转世灵童，他“耽于酒色，不守清规”，“是假达赖”，“请予废立”。
康熙帝接到奏报后，命将仓央嘉措“执献京师”。路经青海的时候，1706年冬天，时年24岁的仓央嘉措突然“死亡”。
如果作为对个人的描述，仓央嘉措在正史中记载的生平其实就是这么多，非常地简单，简单得跟普通老百姓一样。他没有什么伟大的宗教功绩，也没有什么了不起的政治贡献，作为地方领袖，他的生平是没有什么可大书特书的。
不过，正史和野史的记载，都给我们留下了一个“尾巴”。
正史的“尾巴”是对这段历史的补充：在仓央嘉措“死”后，拉藏汗将生于1686年的益西嘉措迎至布达拉宫。据说，这个人是拉藏汗的私生子，拉藏汗拥立他的目的就是要牢牢地掌握西藏政教大权。康熙皇帝批准了这个新的“六世达赖喇嘛”。不过，西藏僧俗群众都认为他才是真正的“假达赖”，并秘密找到了仓央嘉措的转世灵童格桑嘉措。当然，为了避免拉藏汗的迫害，这个灵童被供养在青海的塔尔寺。
至此，当时的青海西藏实际上存在两个“达赖喇嘛”，一个是补缺的新“六世”，一个是候补的“七世”。奇怪的是，清政府对两个都默认。
康熙皇帝清楚西藏局势是很混乱的。1713年，他册封第五世班禅罗桑益西为“班禅额尔德尼”，命他协助拉藏汗管理好西藏地方事务。从此，历代班禅的“额尔德尼”名号便确定下来。虽然册封班禅能尽量地起到稳定作用，但西藏的“历史遗留问题”还是没有得到根本解决。
不稳定因素在于此前跟五世达赖喇嘛、桑杰嘉措交好的准噶尔，因为它的首领噶尔丹是五世达赖喇嘛的弟子，也是桑杰嘉措的同学。在扶持噶尔丹上位的过程中，格鲁派对准噶尔是出过力的。虽然此时噶尔丹已死，但准噶尔势力依然存在，后继者策妄阿拉布坦早已觊觎西藏。1716年，他派大将率6000精兵，打着拥护格桑嘉措进藏、反对拉藏汗倒行逆施的名义，发动了战争，拉藏汗死于乱刃之下。此后，他废掉了拉藏汗拥立的益西嘉措，并对西藏实行了残酷的统治。
三年之后，康熙命皇十四子允禵为抚远大将军，对西藏用兵，打败了准噶尔部，清除了蒙古势力在西藏的政治影响。1720年，康熙正式册封格桑嘉措为“第六世达赖喇嘛”，这就是历史上第三个“六世达赖喇嘛”。不过，1724年，雍正再一次册封的时候，却不提他是第几世，直到1757年格桑嘉措去世，他的真实谱系身份还是没有明确。1781年，到了乾隆朝的时候，清政府册封格桑嘉措的转世灵童为第八世，这也就是承认了格桑嘉措是第七世；而格桑嘉措又是仓央嘉措的转世，那么，这就变相地承认了仓央嘉措是真正的第六世达赖喇嘛。至此，中央政府最终确定了仓央嘉措的真实身份。
以上是正史记载中的“尾巴”。在野史中，仓央嘉措“去世”后的“尾巴”就没有这么多复杂的历史、政治问题了，民间关心的还是他个人。也就是说，这条“尾巴”是对他生平的补充。然而这种补充是如此的五花八门，让人分辨不出它们是传说故事，还是历史真相。
据说，在1706年的冬天，在凄冷荒凉的青海湖畔，仓央嘉措并没有死去，他逃了出来，此后隐姓埋名地活到了64岁。至于他是怎么逃出来的，逃出来之后又去过哪里，这就众说纷纭了，大多数人比较相信的是一种“阿拉善说”。目前似乎也有很多证据证明这是真实发生的。而且，就算还有别的一些说法，和“阿拉善说”也没有本质的冲突，到最后都可以归入到这一大类里。
“阿拉善说”的大概情节是，仓央嘉措逃了出来后，四处云游，先后周游了青海、甘肃、蒙古、四川、西藏、印度、尼泊尔等地。据说他曾当过乞丐，送过尸体，生活极为艰苦。1716年前后，他来到现内蒙古阿拉善旗，从此在此地生活，先后担当了13座寺庙的住持，讲经说法，广结善缘，创下无穷的精妙业绩。1746年，64岁的仓央嘉措染病去世，但他的事迹为广大阿拉善人民传诵，当地人民为他修建了灵塔，供奉了他的遗物。
无论是正史中对历史的补充，还是民间中对个人生平的续写，这两条“尾巴”一加上，仓央嘉措的人生立刻就生动了起来。在生动的背后，又处处充满了神秘色彩，其中总有些让人琢磨不透或者浮想联翩的地方。
这就形成了仓央嘉措的民间化生平。
一个历史人物的生平，若能完全从正史记载过渡到民间化，需要一些前提。首先，正史记载最好不完整、不清楚，太详细了就没有让后人想象发挥的空间，如果正史记载有矛盾之处，想不让民间编故事都难；其次，这个人的经历、命运、性格等总要有点超出常人之处，或者让人敬佩，或者让人同情，或者让人痛恨，总之都要让民间产生极大的好奇心、激起某种强烈的情绪；第三，如果在这个人的经历、命运、性格等细节之处，有大量这样理解也可以、那样解释也说得通的情况，那就非常难得了；第四，需要一些民间文学作品推波助澜，就算没有笔记小说、曲艺戏剧作品来演绎，最少也要有民间传说。
可以说，以上几条，仓央嘉措还真是样样不缺。
造成这种情况的最主要的原因，是关于他的生平中，正史记载中有三个“盲点”。也就是说，在这三处，正史里记载的都不详细，也都容易让人怀疑，民间正好趁着混乱编故事。
这三个“盲点”是三个时间段：第一，童年青少年时期。按照史书的记载是处在秘密监护下学习佛教经典，但在民间，任何“私密生活”都是容易引起好奇心的；第二，活佛时期。也就是他正式成为第六世达赖喇嘛之后的生活状况，史书中有不多的侧面记载，但很令人费解，让人琢磨不透的事情总是可以加工出一些民间故事的；第三，死亡和后事。史书中的记载让人不相信，人们宁愿相信民间故事，况且这些民间故事说的有鼻子有眼，越传越生动、越传越有生命力。
那么，在民间传说中，仓央嘉措的生平是什么样的呢？
需要说明的是，以下的故事是根据若干民间故事整理而成的，其中绝大部分是演绎出来的，这在民间文学中，倒是可以理解的。但为了自圆其说，或者塑造典型环境下的典型形象、故意制造矛盾冲突，故事中很多地方不惜改写历史。要命的是，不光改仓央嘉措本人的，就连和他沾边的、完全可以不改的，也都给改得面目全非。比如，他的父亲在真实的历史中明明活得好好的，但为了突出仓央嘉措的悲惨命运，一出生就先让他父亲死掉了，使他当了几年的苦命娃。所以，如果我们真的把民间故事当成历史，那就大错特错了。
1683年，仓央嘉措出生了，但他是个不幸的孩子：家境本来就很贫寒，又倒霉地遇到了幼年丧父的灾难，只好从小就给别人家做放牛娃；偏赶上他的舅舅和姑姑又是贪财的黑心人，夺走了他家仅有的财产和房屋。
好在，仓央嘉措从小就性格开朗、聪明伶俐，深受乡亲们的喜爱。这一天，几个神秘的僧人来到他家，经过了一系列“考查”后，动员他母亲搬家，并说，这个孩子天资聪颖，是块好材料，不如让寺院来教他学习，这样也能分担一下他家的生活压力。
日子过得本就艰苦，抚养孩子尚且不容易，就更别提让他受教育了，听到这一建议，母亲很愉快地答应了。从此，仓央嘉措就告别了慈爱的母亲，告别了与小伙伴嬉戏玩耍的庭院，告别了山清水秀的故乡，跟着几位僧人来到措那宗的寺院里居住。6岁那年，有6名学问高深的僧人担任他的教师，从此，他开始了枯燥的学经生活。
这里没有平民生活的亲情与欢愉，没有母亲慈祥亲切的爱抚，没有小伙伴们天真烂漫的欢歌笑语，与童稚未脱的儿童、鸿蒙初开的少年终日相伴的，只有老师们道貌岸然的教导训示，以及那些金装彩绘的佛像、菩萨……
这一变化给他童年的心灵留下了深刻的印象，并伴随着他走过少年时期、步入青年。15岁的仓央嘉措，俊秀清朗、英姿勃发。他高高的身材、红润的脸庞、眉清目秀、气宇轩昂，他学会了骑射，剑术高超，身具出色的武艺，很快成为青年男女中瞩目的核心人物。但更吸引女孩子目光的，是他浪漫自由的天性和做得一手好诗的才情。
这时候，他认识了一位美丽的姑娘，她的名字很好听，叫玛吉阿米。他们两小无猜、海誓山盟。仓央嘉措早已经厌倦了学经的日子，他经常返回故乡去看望母亲，并亲手在家乡种了一棵柏树。此时的他，幻想着有一天，带着心爱的玛吉阿米一同回家，过一种浪漫的田园生活。