郑介民担任军统局局长后的军统行动
事实上，郑介民在特务工作和军事战略方面，的确能力出众，但是管理军统，他却并不拿手。或者说，郑介民和戴笠不一样，他不想把军统变成自己的天下，只想在蒋介石手下，做一颗最好的棋子。
1946年10月1日，军统局改组为国防部保密局，郑介民为局长，毛人凤为副局长。郑介民对改头换面的国防部保密局，采取了极力紧缩的政策。前面说过，郑介民在早年蒋介石派他去武汉离间和瓦解桂系部队时，就非常在意明确经费开支，所以，他对新改组的国防部保密局，也大力约束编制和经费。这就使得那些在戴笠手下大手大脚惯了的特务们，颇感不适，这也为郑介民后来在军统的下台，埋下了伏笔。
当时，抗日战争已经结束，军统的主要矛头就转向了共产党。
1947年，郑介民配合蒋介石的内战计划，组织保密局所有特务，紧锣密鼓地对全国各地的中国共产党的地下党进行了严酷的迫害，军统对共产党的迫害达到了前所未有的程度。
郑介民利用保密局的电台等情报设置，截获了共产党地下电台的大量情报，并侦破共产党在北平、西安、兰州、东北等多地的地下电台，逮捕了许多共产党的地下工作人员，破坏了共产党在多地的地下电台。
这里说一件事情，据资料记载，当时，郑介民搜出中国共产党的地下电台后，非常认真地研究了中共地下党的电台。他曾经以为，中国共产党之所以能够广泛而持久地开展地下情报工作，一定是依赖当时的苏联为中共提供的某种新型电台，才能长时间工作而不被军统侦破。然而，当军统特务们把搜获的共产党的地下电台呈至郑介民的办公桌上后，郑介民却大吃一惊，原来，这些电台根本就不是什么苏联提供的新型电台，而是做工非常粗糙的旧式电台。最后，郑介民叹了口气说，这些被共产党当作宝贝的电台，在军统早就被淘汰了，可就是凭着这些电台，共产党的地下党们传送了大量的情报，开展了大量的工作，其效率的确高于军统。
对于中国共产党来说，郑介民是抗日战争结束后，中国内战期间，最重要的特务敌人之一。郑介民并没有辜负蒋介石的授命，虽然他担任军统局局长的时间不过两年，可他却带领军统特务们做了不少工作。他不仅亲自带队破坏了中国共产党上海地下党的一个补给机构，还破坏了中共华中局、苏皖边区政府、华中银行等单位设在上海的联合办事处，搜捕了数十名中国共产党的地下党员。在破坏了上海的许多中国共产党的地下机构后，郑介民还派遣军统特务们，破坏了中国共产党在青岛、宁波、定海、烟台等处的地下后勤机构。
郑介民和戴笠不同，戴笠总喜欢亲自审讯被捕人员，郑介民则相对更喜欢坐在办公室里研究文件；他对于特务们的训诫，也常常是要求他们多做“书面文章”，要求特务们从搜获到的材料中发现线索，要求特务们认真对待破获的共产党的情报中的任何一个词、任何一句话。
郑介民在任军统局局长期间，非常重视对中国共产党的文件的研究，最善于利用中国共产党的政策中的空子进行特务活动。
比如郑介民利用“宗教信仰自由”，指使军统特务中的一些天主教徒和基督教徒到解放地区进行特务活动。其中比较典型的披着宗教外衣进行特务工作的军统特务是比利时神甫雷震远和郑介民派往山西的天主教徒李广。
再比如郑介民利用中国共产党的少数民族政策，先后多次命令军统特务尽力在少数民族中去发展组织。
郑介民任局长时期，许多特务都认为进入解放地区开展特务工作太冒险，太困难，然而郑介民却从中国共产党的文件中找出不少空子，钻空子，想办法向解放区派遣军统特务，甚至在解放区的医生、护士、教师、店员、小商贩等人中布置潜伏特务。可以说，郑介民为了在解放区开展军统特务活动，绞尽了脑汁。
然而从1948年年初，郑介民就辞去了保密局局长一职，可以说是被毛人凤排挤，也可以说是对于军统局的管理力不从心，更可以说是另谋高就。总之，他离开了保密局，然而在仕途上，却依旧一路坦荡。
还是用表格将郑介民在任职军统局局长后，直至去世的所有职位变化总结如下。