广州国民政府不设主席，由国府委员互推唐绍仪、汪精卫、古应芬、孙科、许崇智为国民政府常务委员，依照组织大纲的规定，国民政府委员会议，由常务委员轮流任主席。此外，常委不享有什么特权。但古应芬因与陈济棠系把兄弟，陈事无大小，悉从咨询，所以他权倾一时。汪精卫此次入粤，没有捞到什么好处，郁郁不得志。
广州组府以后，决定将两广军政人事，重新予以调整。在军事上，两广的军队一律取消当时的称号，恢复国民革命军的名称，由国府任命陈济棠为第一集团军总司令，以余汉谋为第一军军长，香翰屏为第二军军长，李扬敬为第三军军长；李宗仁为第四集团军总司令，白崇禧为副总司令，张发奎为前敌总指挥兼第四军军长，廖磊为第七军军长，李品仙为第八军军长，黄旭初为第十五军军长。
在政治方面，由于原任广东省政府主席陈铭枢在蒋介石扣留胡汉民后，态度暧昧，被迫离粤，所遣广东省政府主席一职，初由陈济棠兼代，后国府任命林云陔继任。广西省政府主席自黄绍竑于一九三〇年八月发出“马”电自请辞职后，地方政务由李宗仁总部政务处处理，一九三一年三月二十五日，李宗仁依“革命同志会”的决定，将总部政务处撤销，改组为总司令部政务委员会，以黄旭初为主任委员，对广西省内直接发号施令。六月九日，广州国府依李宗仁的建议，任命黄旭初为广西省政府主席。七月一日黄就职。
当广州组府时期，黄绍竑在香港。李宗仁、白崇禧乘到广州开会之便，特去香港窝打老道看他。李、白坚邀他回广西一行，于是相与起程返桂。黄绍竑到南宁后，李宗仁请他在广西省党部大礼堂对广西军政人员讲一次话。他在讲话中多谈经济建设，但没有提出什么具体建议。不久，汪精卫、孙科到梧州访问，李宗仁特偕黄赴梧接待，当欢迎会举行时，李也请他讲话，黄讲的又是和平建设那一套，不适合当时的政治气氛。李宗仁因对他说：“你这样注意经济问题，请你留在广西担任经济督办如何？”汪精卫、孙科也赞成。他答应到香港后考虑决定。后来黄以蒋要他做广西善后督办，而两广又要他当经济督办，两面均难以讨好，于是离开香港往菲律宾考察去了。
宁粤对峙，广州方面实践其不以武力求统一的主张，并不出兵反蒋，只是唐生智利用唐生明所部第八军在湘南作了一些小规模的活动。蒋介石因五月八日在江西中共中央根据地进行的“围剿”，遭到多次挫败，自顾不遑，也无力对两广下令讨伐。六月十三日，国民党三届五中全会在南京召集，蒋对处理广东事变方针提付讨论。结果认为：江西红军势力日益做大，“剿赤”军事损兵折将，形势日非；当此时期，内战不宜再有，宁粤对峙局面，必须设法疏解，以固国本。十四日，全会对粤局通过了这样一个空泛的决议：“对广东组织伪军政府事，由中央监察委员会查明处理。”这就是说，蒋对广东组府采取等着瞧的态度。
胡汉民被关在汤山几天之后，血压急剧升高，替他看病的只有邓真德医生一人。后来国府卫生署长刘瑞恒到汤山替胡检验，发现胡的血压竟高到一百九十度以上，不禁大惊失色，坚持给胡打针，但胡阻止了他。那时胡对蒋派来的医生已存着戒心了。三月八日，经王宠惠出面劝说，蒋准把胡汉民接回南京双龙巷私宅休养，但行动不能自由，外人也不许随便出入胡宅，这就等于公开地软禁。
到了七月，广州“非常会议”一面订期召开国民党第四次全国代表大会，一面扬言出师北伐。蒋介石为了缓和广州方面的反蒋情绪，七月十三日又准许胡汉民迁往香铺营孔祥熙公馆居住，以示胡汉民有较自由活动的余地。