三桂的愿望如此，然而，他对朝廷有朝一日改变政策不无担心。在洪承畴离云南时，吴三桂曾密求固守之法，巳透露了他的心事。吴三桂并非一介武夫，他对历史颇为熟悉，像“飞鸟尽，良弓藏；狡兔死，走狗烹”一类的惨剧，他应该有所记忆。历代许多王朝，往往在取得了全国的统治权后，大肆屠戮功臣宿将。这就如打猎一样，鸟打尽了，再好的弓箭也没用了；抓到了兔子，猎狗就成了多余，不如与兔子一起杀掉吃肉。吴三桂一想到这一幕幕惨剧，不能不心有余悸。因此，他“怀‘藏弓烹狗的虑深”，极力保住兵权，掌握军队，以图自固，才不致被任意宰剖。
吴三桂对朝廷的疑虑不是杞人忧天。
朝廷把吴三桂的两营部分将官调离云南，以便分散吴三桂的势力。
康熙五年二月，朝廷又进一步采取组织措施，再次削弱三桂的“忠勇”、“义勇”的军事实力。以增设云南开化镇总兵官为名，裁去“忠勇”中营总兵官缺，所属官兵，归并到开化镇统辖，其总兵官由原“忠勇”左营总兵官高起隆出任，并调“忠勇”中营总兵官马宝任曲寻、武飏总兵官。
几经朝廷调动，吴三桂所建的“忠勇”与“义勇”两营巳属有名无实。
在朝廷采取某些组织措施时，特别是傅弘烈等人直书吴三桂有“异志”时，已引起吴三桂的严重不安。
吴三桂手下有个浙江人，叫昌黍子，他献策说：“亲王权尊势重，致使傅（弘烈）、李（棠）敢于参劾。何不营造园、亭，多买歌童舞女，日夜欢娱，使朝廷勿疑。”
吕黍子用的是古人的韬晦之计。就拿刘备来说吧，当年他寄篱曹操之下，惟恐志向被曹操识破，便装得整天无所事事，以侍弄园田自娱。吕黍子让吴三桂追欢逐乐，既符台他的愿望，又避去朝廷的怀疑，何乐而不为！吴三桂感到此策甚好，欣然接受。
吴三桂明白，光是追欢逐乐还不足以释去朝廷之疑，还必须采取实际步骤，拿出行动来。至关重要的莫过于军趴，朝廷对此疑心最大，已屡次讨论要裁减他的部队。于是，他适时地提出裁减军队，力图变被动为主动。至康熙四年五月，在平定水西、乌蒙之后，吴三桂立即请求朝廷，将云南省的额兵进行裁汰。他计划裁去额兵七千二百名，其中将一千八百名兵士调到广罗、蒙景两镇和云州、马龙两营，实裁兵士五千四百名。应裁将官，除总兵官以下将领另行改任外，实裁将领副将一员、参将一员、游击一员、千总二员、把总四员。吴三桂还要求，把他的“忠勇”等五营全部裁去。他要求裁军，正符合朝廷的本意。兵部讨论了他的奏疏，立即表示同意，圣祖批复照准。
吴三桂自请裁去了五千余名士兵，不过是做出了一个姿态，对他的实力还构不成根本损害。
三、假意辞官，康熙顺水推舟
正当朝廷不时以疑虑的目光注视云南时，又发生了有人给吴三桂“上血书”的事件。上书的人，名叫查如龙，他原是南明弘光正权某部的官员，后流落江湖，以反清复明为己志，到处活动。至康熙初年，他伪造全国各省总督、巡抚、提督的书信，其官封、印信、花押、图章非常逼真，令人很难识破。他伪造的信中，都有“联络声气，共图举事，恢复中原”的内容。他把这些伪信汇为一岫，携带身上，前往云南。他宿于离昆明不远的一座寺庙中，咬破食指，给吴三桂写了一封血书，大意是：
天下督抚提镇厦朝中大臣，皆有同心，待王为盟津之会（武王伐纣，套八百诸侯于河南孟津渡口）。大王。您是华人，当年之事（指吴降清），出于不得已。今天下之机杼把握在王的手里，王如果出兵以临中原，天下响应，此千古一大时机啊！
查如龙写好血书，托付一个侍童送到三桂王府。他企图让人们都知道这封信，给吴三桂施加压力，造成迫使他不得不从之势。侍童到了昆明，却没有办法进王府，他徘徊了一阵，返回到寺庙，把信退给了查如龙。投书不成，他到了曲靖府，不慎犯了事，被知府李率祖拿获，所有伪造的信札和写给吴三桂的血书等都被查出。李率祖与吴三桂不和，得此物证甚是高兴。但见其书札稿中牵连各省官员，无一遗漏，就都给烧掉了，只留下血书，申报督抚，上达朝廷。李率祖不能不报告吴三桂，并把查如龙交给他处置。吴三桂命千总董三纲把查如龙押解进京。临行，查如龙大叫：“我死，你灭九族之日也不远了！”至京，朝廷以叛逆十恶不赦之罪判凌迟处死。查如龙写血书，与吴三桂本无关系，但他使朝廷感到吴三桂的存在，总是一个祸根，因此疑忌更深。
尽管吴三桂让出了一部分权利，朝廷对他的防范却日益明显。过去，凡吴三桂提请，兵部、吏部直至皇帝无不应允，大约从康熙五、六年之交开始，吴三桂提补各官，多不批准。此时，吴三桂安插在京师的心腹胡心水刚刚死去，“内外不相照应”，使吴三桂失去了一个耳目，与京师的关系也陷入停顿状态。吴三桂的女婿、胡心水的侄儿胡国柱和重要谋臣、参赞机务的方光琛向吴三桂进言：“朝廷已怀疑王，王应当想个自全之计。”吴三桂以退为进，于康熙六年（1667年）五月上疏朝廷，自感“两目昏瞀，精力日减，请求辞去总管云贵两省事务。
康熙帝马上顺水推舟，同意吴三桂辞去云贵总管的职务。
到康熙六年，吴三桂已满五十五岁，论年龄还没到昏昏然的程度。数年后，他起兵叛乱，精神抖擞，满有劲头，与此时的他判若两人。显见，他说“两目昏瞀”，精力衰减不是心里话。圣祖和廷臣就来个顺水推舟，在对吴三桂的赞扬声中，批准了他的请求，趁机又把他的选任大小官员权收回吏部。吴三桂一看朝廷一意收他的权，干脆把选任武官的权也上缴。朝廷也不谦让，又一并收回。
吴三桂辞总管云贵事，交回用人权，所剩权力无几，仅剩个高贵的亲王名号。他失去了大权，就成了食君禄无所事事的“闲王”了。
一向热中权力的吴三桂，一旦失去权力，心中快怏不乐。他的部属却沉不住气了。方光琛等人着急地说：“王还不明白朝廷的意图吗？”久历朝事的吴三桂何尝不明白！可他能说什么呢？他只有沉默，闷闷不语罢了。
吴三桂自辞云贵总管之后，朝廷迅速削去他在云贵的军政大权。同时也进行了安抚，提升他的大儿子吴应熊为少傅兼太子太傅。同时命吴应熊到云南探望他的父亲。吴三桂也知趣，不敢多留儿子，很快打发他回北京，以显其忠心。
吴三桂辞去云贵总管后，已无多少事可干，差不多每天跟自己的侄儿、女婿等至亲靠近的人在一起宴乐。闲来无事，就跟他们到“箭道”演武场较射比箭。远处悬一铁甲为目标，凡箭能射中、穿透铁甲的，“罪函人”；箭矢弯曲而不能穿透铁甲的，“罪矢人”。后又改为赏赐。此事被朝廷知道（显见朝廷密切注视吴三桂的一举一动），圣祖就派侍卫吴丹前去昆明，携带弓箭数千副，代表朝廷，赏赐给吴三桂的将士。吴三桂陈兵于校场，率左右梅勒、固山、章京等将领，接受赏赐，遥向圣祖谢恩。仪式举行完毕，吴三桂陪同吴丹检阅将士，比射箭法。多谋的吴三桂隐匿精壮将士，专派老的上场比射。吴丹回京复命，报告了他对三桂的考察，朝廷对三桂的疑虑稍为减轻。
康熙十一年（1672年），吴三桂满六十岁，举行大寿庆典。应熊同他的爱妻及其于世瑶一同来昆明祝寿。吴三桂非常高兴，对方光琛等人说：“可见朝廷不疑我，你们都要谨慎些。”
朝廷与吴三桂互相猜疑，也是难免之事。朝廷虑吴三桂势大，与它分庭抗礼，威胁皇权；吴三桂一心世守云南，疑朝廷不履行诺言，惟恐撤其藩地。自云南安定后，被此猜忌日益加深，但双方都很谨慎，尽量消除对方对自己的怀疑。从朝廷方面说，鉴于历代教训，它不会贸然行动，挑起纷争，激化矛盾，这不符合以圣祖为首的统治集团的愿望。从吴三桂方面说，他也不愿意跟朝廷决裂，而决裂就意味着战争，这同样不符合吴三桂的根本利益。双方都想避免矛盾加深，也各自做出一定努力，企图缓和气氛。所以，双方的猜疑也时强时弱。但是，吴三桂以及尚可喜、耿精忠三藩的“独立王国”与清朝中央日益加强的专制体制是无法克服的矛盾。
四、先发制人，谁握主动权
世祖顺治帝在世时，先后封吴三桂、孔有德、尚可喜为王，并派前往南方征剿南明残余。当两广、云贵、福建等省渐次平定，命他们就地驻镇。然而，他们中有的人并不愿意留在南方，提出申请，欲解兵柄北归。
最先提出北归的是定南王孔有德。顺治九年，孔有德上疏：“粤西（广西）业已底定，臣生长北地，与南荒烟瘴不习，每解衣自视刀箭瘢痕，宛如刻划，风雨之夕，骨痛痰涌，一昏几绝。臣年迈子幼，乞圣慈垂鉴，即敕能臣受代，俾臣早觐天颜，优游绿野。”
孔有德陈情，言词恳切，令人生怜爱之心。他长期征战，多处受伤，留下了斑斑伤痕，经受不住南方湿热气候的煎熬，烟瘴之气更使北方人感到畏惧。他惟一的儿子还不足十岁，倘若自己一旦染病，妻与子何以依赖！他不愿留镇广西，实出自内心的真情。他期望解除兵权，回到北京，天天伴侍皇帝，得以清闲无事，“优游绿野”，以终天年。他在奏疏中的最后这段话，强烈地表示了功成引退之意。
尚可喜以年老引退的方式，向朝廷表达了自己始终不渝的忠诚，是维护中央集权的一个主动退让，因而博得了圣祖的高度评价，在褒美中含蓄地赞赏他知趣，“能知大体”，自动去位，使君臣两无嫌猜，共享太平之福，这层意思虽没有说破，彼此已心照不宣地猜透了对方的心事。圣祖的谕旨，证明尚可喜以明理求善终，实为明智之举，显示年迈的尚可喜计虑深远。
尚可喜在申请撤藩时，提出一个条件，即留镇长子尚之信于广州，由他承袭平南王爵。
户、兵两部根据圣祖的指示，提出如下具体意见：
关于尚可喜把王爵让给长子尚之信承袭问题，就现有各藩王例，“子无移袭之例”，无须再议。否决了尚可喜的要求。
关于如何撒藩的问题，吏、兵两部认为，经查尚可喜有十五佐领的兵员，可携带两佐领官兵家口迁居辽东。但尚之信统兵留镇，将使父子分离，况且藩下将士早年就与王共甘苦，如今因撤藩，造成他们两地离析，是不合适的，应全迁为便。兵部特别提出：平南王藩下有绿旗官兵共六千名，原驻广州府，今可喜父子迁移，这六千绿旗官兵应留在广州，命广东提督臣统辖，至于一切夫马舟船，等尚藩开列人口、马匹确切实数，在离广东之时，即遣官拨给。
圣祖批准实施。
尚可喜的本意，并非是全撤，他自己要携带部分家口和兵丁撤回关外故乡，而想把王爵传给长于尚之信，让他继续留镇广东。尚可喜厌怒他，不愿和他在一起生活。尚可喜有于三十二人（其中过继一于），尚之信为长，按封建继承法，又不能不让他承袭。所以，尚可喜自请回辽东，既可保留王爵传之子孙，而自己急流勇退，获晚年安宁。但朝廷以父亲健在无移爵的先例，予以拒绝。并以不忍其父子分离、藩下家口分离为由，下令全撤。尚可喜看得很明白，朝廷的意图是彻底撤藩，从根本上解除它的心腹之忧。既然这样，尚可喜自然无话可说。朝廷锐意全撤，虽非尚可喜本愿，事已至此，他只有俯首听命，服从朝廷的决定了。圣祖派遣钦差持诏书，子同年五月三日送到广州。尚可喜“拜命之后，即缮书称谢，遂陆续提报起程日期、家口马匹数目”，着手准备迁移事宣。
自尚可喜撤藩引起的一场政治动乱已迫在眉睫。
五、弄假成真，木已成舟
圣祖批准尚可喜撤藩的决定，迅速向朝廷内外包括各省军政官员作了通报。吴三桂、耿精忠两藩得知这个消息，心中惶惶不安。他们根本就没有撤藩的思想准备，一次也不曾提过或表示有撤藩之意，如今朝廷同意尚可喜撤藩，实则也强烈地暗示他们，是考虑自己应否撤藩的时候了。朝廷的举动，又暗示他们，是自请搬好，还是等朝廷下令撤你们好，由你们作出选择。
在朝廷阁臣正讨论尚可喜撤藩时，吴应熊探得朝廷意图，迅速秘密派人驰往昆明，向吴三桂传话：“朝廷素来就怀疑王，尚藩、耿藩都已提出辞职疏奏（耿藩辞职，是指康熙十年春耿继茂以病辞职事），惟独王从没有提出辞职，朝廷对王的疑忌更深了。要赶快写奏疏，派遣使者进来，还来得及。”吴应熊要他父亲也效法尚、耿的做法，然后从中谋划，在“弥缝”中可以把自己留下来。
到这个时候，吴三桂还是无意撤藩。在这个问题上，他没有尚可喜那样明智、有远见卓识，还在力图保住自己的利禄名位，幻想世守云南。他也明知，朝廷对他不放心，这使他的思想陷入深深的矛盾之中，而尚可喜自请撤藩，又把他置于进退维谷的境地。撤吧，实非本愿；不撤吧，朝廷对自己的疑忌如此之深，如何是好？他徘徊不定，顾虑重重。倘走错一步，会导致无法预料的后果。他召来一班亲信，反复商酌。意见不尽一致。有一部分人主张，不嫡先提出申请，看朝廷到底是什么态度再说。最后，他觉得这个主意可取，跟儿子的建议基本一致，决定提出撤藩的申请。
于是，吴三桂俞幕僚刘玄初起草辞职疏。玄初是四川人，原先在蜀王刘文秀府中，充任幕客，颇善谋划。刘文秀失败，吴三桂将他收留，放在自己身边，不时顾问咨询，很得信任。吴三桂让他写奏疏，他却持与众不同的看法。他对吴三桂说：“皇上很久就想把王词离云南，但特难开口。王上疏，一定会朝上而夕调。尚、耿两王愿辞就让他们辞去，王可永镇云南，为什么非要效法他们呢？王不可上疏！”
吴三桂一听此言，大伤他的尊严和自信心，很恼怒，气冲冲地说：“我马上就上疏，皇上一定不敢调我。我上疏，是消释朝廷对我的怀疑。”
康熙十二年七月三日，吴三桂给圣祖上了一道自请撤藩的奏疏，他写道：
臣驻镇滇省，巨下官兵家口于康熙元年迁移（指从汉中迁云南），至康熙三年迁完。虽家口到滇九栽，而巨身在岩疆已十六年，念臣世受天恩，捐糜难报，惟期尽瘁蒋篱，安敢遽请息肩！今闻平南王尚可喜有陈情之疏，已蒙恩鉴，准撤全藩。仰恃鸿慈，冒干天听，请撤安插。
康熙马上同意了撤藩，但他没有考虑到撤藩带来的巨大后果。而大多散廷臣对撤吴藩已表示出顾虑重重。他们为什么坚持不同意撤吴藩？正如他们已向圣祖所表示的见解，他们考虑到云南虽然平定，但那里的情况复杂，潜伏着一定危险，如吴藩一撤，局势不稳，担心会出现反复。要说吴三桂图谋不轨，还没有抓到谋反的证据，朝廷无法说出口，以他对清朝的特殊功绩，贸然撤藩，未必令人心服。吴三桂早已变通朝中诸臣，关系密切，他们是同情他的。在他们心中还有一层隐忧：“三桂专制滇中十有四年，位尊权重”，处理不当，后果不堪设想。