威尔伯弗斯对生物学一窍不通，对进化论极端无知，逗得听众哄堂大笑。他却自鸣得意，越讲越起劲，满以为已经把达尔文学说挖苦够了，已经给听众造成进化论只不过是一个荒谬学说的印象了。其实，大主教的胡说八道，仅仅引起台下一批教士和天主教教徒的喝彩、鼓掌，甚至一阵阵歇斯底里的狂叫。大主教环视了一下会场以胜利者自居，突然转身向静坐在一旁听讲的赫胥黎教授，用挑衅的口气恶狠狠地进行人身攻击说：“最后，我想问一句坐在我对面的、企图把我撕碎的赫胥黎先生，你相信猴子是人类的祖先，那么请问你，究竟是你的祖父还是你的祖母，同无尾猿发生了亲属关系？”
大主教在大肆攻击进化论学说之后，又以上帝代表的身份警告说：达尔文学说污辱了神圣的教义，是一种异端的学说，决不能让它存在。
多么令人发指的挑衅！骚动的人群把目光集中在赫胥黎的身上。这时候，赫胥黎从容地登上讲台，用他一贯富有战斗气质的高昂声音阐述了达尔文进化论的内容，指出这个学说不是凭空捏造出来的，而是建立在20多年的观察研究基础上的，反映了生物世界的客观规律。它是科学的真理，人类智慧的结晶。赫胥黎以雄辩的事实，富有逻辑性的论证，同大主教那种内容空洞、语无伦次的谩骂，形成了鲜明的对比，全场鸦雀无声。
赫胥黎慷慨激昂地说：“刚才主教嘲笑我们‘粗野愚蠢’，我敢预言，现在牛津大主教的名字将来被人遗忘之后，这个被大主教称为‘粗野愚蠢’的原理的创始人的名字，将要被人们一个世纪一个世纪地纪念下去。这已经不是第一次了。在历史上，凡是有关地球的重大发现，都跟当时的基督教统治相抵触。当伽利略提出证据，证明地球不是宇宙的中心，而是跟其他行星一起围绕太阳绕转的时候，基督教就把他当成异教徒判了刑。他被迫沉默了。但是，地球却在继续绕太阳旋转。我要奉劝大主教大人，科学的真理愈来愈多地被人类揭示出来，这是我们的骄傲和光荣！只有那些不承认事实而利用宗教蒙蔽人民的人，才是愚蠢无知和真正应当感到羞耻的！”
最后，赫胥黎用铿锵有力而富有幽默感的语言回敬了大主教的挑衅。他说：“是的，自然界漫长的进化历程，确实有类似猿猴的动物。我过去说过，现在再说一次，一个人没有任何理由因为他的祖先是无尾猿而感到羞耻。我感到羞耻的倒是这样一种人：他惯于信口雌黄，用花言巧语和诡辩的辞令来蒙蔽人，粗暴地干涉他根本不理解的科学问题，企图煽动一部分听众的宗教偏见来压倒别人。这才是真正的羞耻啊！”
话音刚落，进步的听众，特别是青年学生立刻报以热烈的掌声。这是牛津大学有史以来第一次敢在大庭广众之下这样有力地谴责主教大人。因此，威尔伯弗斯气得面如土色。刚才还如颠似狂地为大主教的诡辩喝彩的布留斯特夫人当场气昏过去。贵妇人们尖叫起来，人们手忙脚乱地将布留斯特夫人抬出会场。辩论会只好暂停，一会后又继续开。亨斯洛主席邀请霍克上台发言，要他就植物学方面发表一下对达尔文进化论的意见。
霍克走上讲台，他着重用事实证明大主教根本没有看懂《物种起源》，甚至缺少有关植物学的最起码的知识。原来神气活现的大主教听了霍克发言以后，自知理屈词穷，不敢上台答辩悄悄地溜出了会场。听众再一次向进步学者，向真理的捍卫者们报以热烈的掌声。会议就在进化论大获全胜的气氛中宣布结束了。牛津大主教掀起的这场轩然大波平息了。当然，他是不会甘心失败的，还要网罗反对进化论的势力，继续发动进攻。但是，在英国像这样大规模地围攻进化论的论战再也组织不起来了。
真理是不可战胜的。达尔文学说的影响越来越大，在英国已经家喻户晓了。但是，斗争并没有结束，在这以后的20年里，英国教会始终没有停止对达尔文的攻击。1877年，达尔文的母校剑桥大学为了表彰他对科学的伟大贡献决定授予他荣誉学位。在举行仪式的大会上，保守势力仍然没有放弃捣乱的机会。当达尔文在致答词的时候，有几个坐在厢楼上的落后学生，在保守势力的指使下，牵出一只猴子，高高举起，使它乱跳乱叫，这是企图污辱达尔文并且扰乱会场的拙劣表演。但是达尔文从容自若地把话讲完了，全场师生向他热烈鼓掌欢呼。掌声和欢呼打击了捣乱分子的气焰，进化论者又一次获得了胜利。
更鼓舞人心的是早在达尔文从事进化论研究的时候，无产阶级的革命导师马克思、恩格斯就给予了密切的关注。
恩格斯不但将达尔文的学说誉为19世纪的世界三大发现（细胞的发现、能量守恒和转换定律、生物中的进化论）之一，而且他在马克思墓前哀悼的时候说：“正像达尔文发现有机界发展规律一样，马克思发现了人类历史的发展规律。”这是伟大革命导师对达尔文创立进化论的高度评价。
达尔文一直珍藏着马克思赠送给他的那本伟大著作，现在还陈列在达尔文的故居里，成了19世纪这两位巨人之间友谊的见证。
由于达尔文学说的胜利，达尔文成了世界闻名的科学家。曾经疯狂地反对过他的“势力”的社会，转回头来拼命地为他捧场。各种证书、奖章像雪片一样飞来。他成了英国、德国、法国、美国、俄罗斯、意大利、荷兰、比利时、丹麦、葡萄牙、西班牙、瑞典、印度等国70多个科学协会、大学的名誉会员、名誉院士、名誉教授。除此之外，他还获得了各式各样名目的博士称号，什么剑桥大学名誉法律博士、波恩大学名誉医学外科博士、比勒斯劳大学名誉医学外科博士，等等。地质学会授给他华拉斯登奖章，皇家学会授给他皇家学会奖章和柯普雷奖章，皇家医学院授给他贝勒奖章，有的还向他颁发了奖金。
在各种荣誉面前，使达尔文感到“极大的满足”的礼物只有两件。这就是1877年在他68岁生日那天，从德国和荷兰分别寄来的两本贴满照片的相册：一本是德国蒙斯特的雷德先生发起组织的154位科学家照片的相册；另一本是贴有荷兰班墨兰教授等217位著名观察家和自然科学爱好者的相册。达尔文欣喜万分，坐在高脚的椅子上，一边翻看这两本装贴得富丽堂皇的礼物，一边自言自语地说：“这是我曾经得到的最高的荣誉，我非常感谢他们的盛情和慷慨的同情。”他在给两位发起人复信致谢时说：“这些礼物使我感到了极大的满足，我认为再也没有比这个更使我感到光荣的纪念品了。当我死去的时候，这些照片将是留给我的孩子们的一份珍贵的遗产。”
当赫胥黎、霍克在英国论坛上冲锋陷阵的时候，进化论的主帅达尔文在与病魔顽强地搏斗着，他感到身上的担子更重了，不仅要为新的学说呐喊、呼吁，而且，还有更多的工作等着他去完成。他正在紧张地赶写着一些著作，为进化论大军提供威力强大的炮弹打击进化论的敌人。
这时，达尔文的身体越来越坏了。除了恼人的胃疼、头疼、剧烈的呕吐、肌肉不自主的颤抖以外，他又复发了心脏病。疾病常常迫使他成天躺在沙发上。为了治病，达尔文同全家一起，搬到北威尔士去休养。他们居住的那座房子有个美名：凯尔殿。
达尔文感到身体稍微好转以后，便从长沙发上爬起来，挣扎着拼命工作。从1860年到1872年间，他在与疾病的斗争中，完成了《动物和植物在家养下的变异》、《人类起源与性选择》、《人类和动物的表情》3部生物学经典巨著。这3部巨著一上市，就一售而光，给予各国进化论者以有力的支持。
达尔文在最后10年中，做了大量的科学实验，写了许多的论文和著作。从这些论文和著作中，显示了一个贯穿于他一生的特点，那就是他愿意试验大多数人认为丝毫不值得试验的东西。他把这些颇为大胆的试验称为“愚人的试验”，并从这些实验中获得了惊人的成果。他把这些成果写进《食虫植物》、《攀缘植物》、《植物的自花受精和异花受精》、《同种植物上花的不同形态》、《植物的运动能力》等书中。
写完了这些书，达尔文已快走完了自己的生命历程，他把全部精力奉献给了科学，奉献给了人类。1882年4月15日，一场无法逆转的重病发作了，晚餐后达尔文想走到沙发那里去，但他一下子昏倒了。4月17日，在他病逝前两天，他觉得稍好一些，便挣扎着爬起来走到试验地去，为儿子法兰士记录一个实验的进展情况。已经成为生物学家的法兰士，闻讯匆匆赶到试验地，搀扶着父亲，心疼地劝道：“爸爸，你不用再为科学工作操心了吧，我会完成这些实验的。”
达尔文叹息了一声：“但是，除了科学工作，我没有其他的事可以做呀！”
法兰士感动地说：“亲爱的爸爸，你已为人类作出了巨大的贡献，你现在惟一应该做的，你也有充分权利做的事就是：休息。你要保重身体，不要把精力耗尽了呀！”
达尔文摇摇头，说：“不论一个人的精力是早一两年还是晚一两年耗尽，这都是无关紧要的事。我不能忍受无所事事的生活。”
达尔文为科学做了最后一件工作后的第二天晚上，他便昏迷过去，处于弥留状态了。衰弱的埃玛和儿子法兰士守在他的病榻旁，费尽心机地使他醒过来。埃玛紧紧抓住丈夫的手，害怕他骤然离去。达尔文使出最后的力气，亲切地对埃玛说：“我的亲爱的朋友，你为我奉献了一生。在我多病的后半生，你没有离开过我一晚。没有你所做的一切，我要为科学作出贡献，是不可想象的。现在，我要先你而去了。你不用难过，我并不怕死。回顾我的一生，我曾不断地追随，并且把我的一生献给了科学，我相信我这样做是正确的。我没有犯过任何重大的罪，所以我不会感到痛悔，但我常常感到遗憾的是，我没有使人类受到更直接的益处。”
1882年4月19日，凌晨4时，达尔文在居住了40年的唐恩镇家中静静地离开了人世，终年73岁。
达尔文为科学事业而战斗，直到生命的最后一息。死后安葬在距牛顿墓只有几米的地方。
巨星陨落，举世悲恸！世界各地发来唁电唁函，沉痛悼念19世纪最伟大的科学家——达尔文。
达尔文的生前好友和并肩战斗过的科学家们聚集在一起，讨论安排他的后事。
20名国会议员联名给伦敦威斯敏斯特教堂教长勃莱德雷神学博士写信，要求把英国人民的骄傲达尔文葬在威斯敏斯特教堂中。当时，勃莱德雷教长正在国外，他在电报里热忱地同意了这个建议，并马上执行。
1882年4月26日，在威斯敏斯特教堂举行了隆重的葬礼。英国皇家学会主席、美国公使等显要人物同达尔文的好友霍克、赫胥黎、华莱士等一起，扶着达尔文的灵柩，将他安葬在距伟大的物理学家牛顿的墓只有几米的地方。两位科学巨人平排在一起，共同享受着英国科学家的最高荣誉。
参加达尔文葬礼的还有法、德、意、西班牙、俄罗斯等国的代表，各大学和各学会的代表以及他的许多朋友和知名人士。
在达尔文的墓碑上刻着下列的字样：
查理·罗伯特·达尔文
生于1809年2月12日
死于1882年4月19日
人们永远怀念达尔文这位为不断追求真理并且做出划时代贡献的伟大科学家。他创立的进化论，在生物学上引起一场巨大的革命，触及到生物学的各个分支，带来了生物学百余年来的长足进步。如今，生物学已经在工业、农业、医学方面得到了广泛的应用，给人类创造了难以计数的财富。
达尔文留下的22部著作和80余篇论文成了人类宝贵的文化遗产，它已经为人类的进步发挥了巨大的作用，现在和将来仍然会继续发挥作用。