第二天，一觉醒来，我觉得头脑特别清醒。令我惊奇的是，我竟然躺在自己的房里。想必我的同伴们也被送回到他们住的房里了。也许他们同我一样毫无知觉。昨晚所发生的事情，他们同我一样一无所知，而要想揭开这个秘密，我只能期待将来的偶然机会了。
因此这时，我在盘算着怎样离开我的房间。我将重获自由，还是跟眼前一样，成为一个阶下囚？但是，我完全自由了。打开房门，沿着过道，我登上了中央扶梯，昨夜关闭的嵌板现在正敞开着，于是，我来到了平台上。
尼德·兰和康塞尔正在那里等着我。我询问过他们，他们什么都不知道。他们昏昏沉沉地睡着了，不记得任何事情，他们都对醒来发现回到自己房间，感到非常诧异。
关于“鹦鹉螺号”，我们觉得它依旧安静沉寂地披着神秘的面纱。此时，它漂浮在海面上，缓缓前行。船上仿佛什么事情都没有发生。
尼德·兰用他那犀利的目光眺望着大海。海上荒无人烟。这个加拿大人特别注意看了看远处天际，仍然什么都没有发现，既没有看见船，也看不见陆地。这时西风呼啸，风掀起层层巨浪，使得船只明显地晃动起来。“鹦鹉螺号”换过空气之后，保持在平均深度为15米的海洋中行驶，这样，它就能快速地返回水面上。这种不同于以住的航行方式，在1月19日这一天进行过许多次。这时，大副登上了平台，他又说了那句常说的话。
至于尼摩船长，不见他露面。船上的人员中，我只见到那个冷漠的侍者，他仍旧像平时那样，准时地、默默地给我送饭。
接近下午2点时，我在客厅里忙着整理我的记录。尼摩船长打开门，走了进来。我向他打了招呼。他微微向我点了点头，并没有跟我说话。我又继续做我的事情，同时期望他能向我解释昨晚发生的事，可是他一言不发。我特意打量了他。我觉得他疲惫不堪，他那双眼睛因睡眠不足而带血丝，表情显得深沉、忧伤且痛苦。他来回地踱步，坐下去又站起来，一会儿拿起一本书一会儿又放下来，看看他的仪器可又不做平常的记录，就这样，他似乎是一刻都不能安定。
终于，他向我走过来，询问我：“您是医生吗，阿罗纳克斯先生？”
我没料到他会问我这个问题，我奇怪地盯着他看了一会儿，没有回答。
“您是医生吗？”他再一次问道，“您有好几位同事都曾经学过医，比如格拉蒂奥莱、摩丹·唐东，以及其他一些人。”
“的确，我是医生和住院医师，在我进博物馆工作之前，我曾经行医数年。”我说道。
“好的，先生。”
显然我的回答令尼摩船长感到满意。但我不知道他为何提及此事，我等着他提出新问题，好让自己根据具体情况再作出答复。
“阿罗纳克斯先生，您愿意来治疗我的一名船员吗？”船长问道。
“这里有病人？”
“是的。”
“好，我这就跟您去看看。”
“请吧。”
我承认，此时我心潮澎湃。不知为什么，我总觉得这个船员的病与昨晚发生的事有着某种关联，而这秘密，至少跟那个病人一样，一直困扰着我。
尼摩船长领着我来到“鹦鹉螺号”的后部，让我进了水手舱隔壁的一间船舱。
这间舱里，一个40来岁的男人躺在一张床上，他外貌刚毅，是一个典型的盎格鲁—撒克逊人。
我朝他俯下身去。这个人不仅有病，而且还受了伤。他的头部缠着渗血的纱布，头下枕着两个枕头。我解开绷带，这个伤员用两只无神的大眼睛注视着我，没有发出一声呻吟。
伤口非常吓人，头盖骨被一种钝器敲碎了，脑髓裸露出来，脑质受到了极度擦伤，到处都是如酒渍色的血块，脑子不但受了挫伤，还受到了震荡。病人呼吸缓慢，肌肉痉挛，脸部在抽搐，大脑发炎，而且伤者已经失去了感觉和行动的能力。
我为这个伤者把了脉，脉搏已是时有时无。他身体的各部位已经变冷，我看他将死去，无可救药了。给这个不幸的人包扎完后，我还为他调整了一下他头上的绷带，然后就转身问尼摩船长：“这伤是怎么回事？”
“这无关紧要！‘鹦鹉螺号’发生了碰撞，机器上的一根操纵杆被撞断，断了的操纵杆正好击中了这个人。您觉得他的伤势如何？”船长支支吾吾地回答。
我迟疑着没有说话。
“您尽管讲，这个人听不懂法语。”船长说道。
我看了伤者一眼，回答道：“这人活不过2个小时。”
“没有办法医治了吗？”
“没有一点办法了。”
尼摩船长的手颤抖起来，从他眼眶里流出几滴眼泪来，我一直都以为他不会掉泪的。
我又仔细地观察了这个生命垂危的伤者，他的生命正缓缓地逝去。在笼罩病床的电光照射之下，他的脸色显得越发苍白。我看见他智慧的额头上过早地留下了一些皱纹，这大概就是长期以来遭受不幸与贫困所留下的印记。我希望从他两片嘴唇间吐出的临终遗言中，能意外地获悉他平生的秘密。
“阿罗纳克斯先生，您可以离开了。”尼摩船长对我说道。
于是，我让船长独自留在那生命垂危的人的房舱里。我回到了房中，仍为刚才所见的一幕而久久不能平静。接下来的整整一天里，我始终因某些不祥的预感而烦躁。这夜，我睡眠不好，常常惊醒，我仿佛听到了远处传来的叹息声和哀伤的歌声，仿佛阵阵哀乐。这难道是在用那种我听不懂的语言，低声诵念着给死者的悼词？
第二天早晨，我登上了甲板。尼摩船长早已经在那里了。他一看见我，便向我走了过来。
“教授先生，您愿意今天去做一次海底漫游吗？”他问我道。
“跟我的同伴们一起去吗？”我问道。
“只要他们愿意。”
“我们愿听从您的吩咐，船长。”
“那请你们去换上潜水衣吧。”
他再也没有提及那个生命垂危的人，或者说是已经死去的人。我去了尼德·兰和康塞尔的房间，把尼摩船长的建议告诉了他们。康塞尔立刻赞同。这一次，那个加拿大人也打算同我们一起去了。
这时，正值早晨8点。8点30分，我们已经换上了为海底漫步准备的潜水衣，带上了探照灯和氧气罐。那扇双重门打开了，尼摩船长走了出来，身后跟着十几个船员。“鹦鹉螺号”停泊在水面下10米深的地方时，我们踏上了那坚实的海底。
走下一个斜坡之后是一处高低不平的洼地。这个洼地大约深15法寻，跟我第一次在太平洋海底散步时看过的并不相同。这里没有细沙，没有海底草地，也没有深海森林。我立刻意识到这就是尼摩船长那天许诺带我们去的神奇地方。这就是珊瑚王国。
在植虫动物门和海鸡冠纲中，包括柳珊瑚目，这一目又包括柳珊瑚、木贼和珊瑚三科。珊瑚属最后一科，这种奇怪的物质先后被归入矿物、植物和动物界。古人把它当做良药，近代人把它视为珍宝，只是到了1694年，马赛科人贝桑耐尔才把它明确归入动物界。
珊瑚是聚集在易碎的石质珊瑚骨上的一种微小动物群。这类珊瑚虫具有独特的繁殖力，它们通过芽生生长繁衍。它们既有着自身生命，也有着彼此共同的生命，因而可以说这是一种大自然的社会主义。我了解有关这种奇异的植虫动物的最新研究成果。根据博物学家非常正确的观察，这类动物在发生矿化作用的同时，形成树枝状的结晶体。对我来说，没有什么比去参观大自然在海底培植的石化森林，更令我感兴趣的了。
打开了兰可夫探照灯，我们沿着正在形成的珊瑚层向前走，随着时间的推移，这珊瑚层总有一天会将印度洋上这一部分海面封住。路旁长满了一些杂乱无章的小珊瑚树丛。小珊瑚树上面布满闪动着熠熠白光的星状小花朵。不过，与陆地上植物的生长规律相反的是，这些牢牢附着在岩石上的珊瑚树杈，其生长规律则是自上而下生长的。
灯光照射到这些色彩艳丽的珊瑚树树叶上，熠熠生辉，一派迷人景象。我仿佛看见那些圆柱形薄膜细管，在水波下荡漾。我尝试过采摘几瓣它们那带有娇嫩纤细触须的新鲜花冠。这些花冠，有的刚开放，有的则含苞欲放。这时，一些身体轻盈鳍摆迅速的鱼，如飞鱼般一掠而过。当我的手稍一靠近这些有生命的花朵，挨近这些活脱脱的含羞草的时候，花丛中便会立即发出警报，那白色的花冠就缩进红色的花套里去，花朵在我眼前消失了，那珊瑚丛则变成一团圆形的石丘。
这次偶然的机会，让我目睹了这种植虫动物中最为珍贵的品种。这类珊瑚完全可以跟在地中海、法国、意大利和巴巴利海岸处打捞到的珊瑚相媲美。这种珊瑚中最漂亮的几个品种，因其艳丽的色泽，在贸易中被赋予“血花”、“血沫”之类的美誉。这种珊瑚在贸易中卖到每公斤500法郎。而在这里，海水下面还蕴藏着无数珊瑚打捞者们的财富。这种珊瑚常常掺杂着其他珊瑚骨的珍贵物质，形成一种名叫“马西奥达”的斑驳的、质地密实的珊瑚块，在这上面，我也看到了一些奇妙的玫瑰珊瑚品种。
没过多久，珊瑚树丛变得更加紧密，它们那结晶体树枝正越发粗壮地生长着。随着我们前进的步伐，我们面前出现了一片真正的石质丛林，以及一种结构怪异的长珊瑚枝。尼摩船长走进一条光线晦暗的长廊，这条长廊平缓的斜坡把我们引向了100米深处的海底。蛇形玻璃管的灯光照射在那些外表粗糙、凹凸不平的天然门拱上，照射在像分支吊灯一样分布的、如火花般闪耀的顶上，不时产生一些魔幻的效果。在这种珊瑚灌木丛中间，我发现一些奇怪的珊瑚骨，海虱形珊瑚、节肢蝶形珊瑚，以及几簇珊瑚藻。这珊瑚藻红绿相间，它们是外面包裹着石灰盐的真正海药。经过博物学家们长期争论之后，它们最终被归入植物界。但是，根据一位思想家的观点，“生命正默默无闻地从无知觉的沉睡中苏醒过来，可是并没有脱离其初始粗犷状态，这大概就是它的真实意义所在”。
走了2个小时之后，我们来到了海下约300米的地方，那是珊瑚形成的深层范围。在这里，见到的不再是孤零零的珊瑚灌木丛，也不再是不显眼的低矮的乔林丛木，而是一大片森林，是又高又大的矿化草木，是一些巨大的石化树。它们同一些美丽的羽毛花彩状植物汇集在一起，而这类海洋藤类植物披上各色各样的盛装之后，越发光彩照人。我们在隐没于海水阴暗之中的高大树枝底下自由自在地穿行，在我们的脚下，那些管形珊瑚、脑珊瑚、星形贝、菌状贝、石竹形珊瑚，形成一条鲜花地毯，闪烁着耀眼的光芒。
真是难以描绘出来的景色啊！我们的感受难以言表！为什么我们要被禁锢在这个玻璃与金属制成的圆盔里面？！为什么我们彼此之间无法用语言交流？！我们希望能像鱼类一样在水中生活，或是更进一步，过上两栖动物一样的生活，可以长时间地随意往来于海陆之间！
这时，尼摩船长停下了脚步。我和我的同伴也停止了前进。我转过头来，看见船员们都围在他们首领身边，形成一个半圆形。我再仔细地看了一下，看见其中4人正扛着一个长方形的物体。
我们站立在林中一块宽大的空地的中心，四周被海底森林那些高大的树木所环绕。探照灯投射在这片森林中，光线混沌昏暗，把投射在地上的影子拉得特别长。在那空地的尽头，光线越发昏暗，只有几缕微光照射在珊瑚的棱角处。
尼德·兰和康塞尔就在我的身边。我们都在全神贯注地看着，此时一个念头在我的脑海里一闪而过：不久，我将会看到一个奇特的场面。我看着地面，发觉有些地方鼓起，被一层石灰质积淀物包裹，它们被人为地有规律地排列好。
在这片林中空地的中央处，在一处堆砌混乱的岩石基座上面，竖起一个珊瑚制作的十字架，上面伸展着两条仿佛用石化血珊瑚制成的长长横档。
尼摩船长做了个手势，其中一个船员走上前来，在距离十字架几英尺的地方停下来，从腰间取下铁锨，开始挖坑。我完全明白了！这处林中空地原来是墓地，这个坑就是坟墓，那长方形的物体就是昨夜死去的那个人的尸体！尼摩船长和他的船员到这个公共墓地，到这个与世隔绝的海洋深处，是来埋葬他们死去的同伴的。
不！我从来没有感觉这样震撼！从来没有这么强烈的念头涌入过我的脑海！我真不愿意看到眼前的一切！
然而，他挖得很慢，惊动了鱼群，它们立刻四处逃散。我听到铁锨与石灰质地面摩擦发出的声音，有时碰到掉落在水底的火石，溅起点点火星。墓穴逐渐变长、变宽，不久，它的深度就可以容纳下那具尸体了。
于是，那些抬尸人走近墓穴。用白麻布包裹着的尸身被放进了潮湿的墓穴中，尼摩船长双臂十字交叉放在胸前，死者曾经爱过的朋友都跪下来，在做祈祷……我和我的两个同伴也虔诚地鞠躬致哀。
坟墓被从地上挖出的碎石块盖了起来，形成一个微微凸起的坟包。
埋葬好后，尼摩船长和他的船员都站起身来。接着，大家走到坟前，屈膝伸手，做最后的告别……
葬礼结束，送葬的队伍按原路返回。在那森林的门拱之下，在那矮树丛间，我们沿着珊瑚丛走上斜坡。
终于，我们能看到潜艇的灯光了。长长的光线把我们一直引向了“鹦鹉螺号”所在的地方。下午1点钟，我们回到了船上。我一换过衣服，便立刻登上了潜艇的平台，走到舷灯旁坐了下来。一种可怕念头纠缠困扰着我。
尼摩船长走到我的跟前。我站了起来，问道：“正如我所预料的那样，那人是昨夜死去的吗？”
“是的，阿罗纳克斯先生。”尼摩船长回答。
“那现在他是长眠在那块珊瑚墓地，在他的同伴身旁吧？”
“是的，他们会被人们所忘记，但是，我们却除外！我们挖好了坟墓，而那些珊瑚虫会恪尽职守地把我们的死者永远封闭起来！”
接着，这位船长用颤抖的手捂住脸，他无法抑制地哭出声来。过了一会儿，他说：
“在那里，在那大海波涛下几百英尺的地方，就是我们僻静的墓地！”
“船长，您那些死去的同伴，至少可以安静地长眠在那里，而免受那些鲨鱼的伤害！”
“是的，先生，免受鲨鱼和人类的伤害。”