尚供总管府，掌守护东凉亭行宫及游猎供需之事，延祐二年（1315年）由只哈赤八剌哈孙达鲁花赤（至元十三年设）改立，泰定四年（1327年）二月划隶上都留守司管辖。
云需总管府，掌守护察罕脑儿行宫及行营供办之事，置于延祐二年（1315年），亦于泰定四年（1327年）二月划归上都留守司管辖。③（参见《元史》卷三〇，《泰定帝纪二》）
（5）营造诸司
修内司，掌营修内府，设于至元八年（1271年）。
祗应司，掌宫殿、王府、寺庙妆銮油染裱褙。
器物局，掌制造铁器及内府营造钉线。
八作司，掌都城造作，设于至元十七年（1280年）。
（6）仓库及税课机构
上都税课提举司，原设宣课提领，至元十九年（1282年）二月改为宣课提举司，元贞元年（1295年）又改为税课提举司。
万盈库，建于中统初年。
广积仓，大德年间（1297—1307）由永盈仓（亦建于中统初年）改置。
万亿库，建于至元二十三年（1286年）。平盈库，建于至元三十年（1293年）。
万盈仓，建于至元三十年（1293年）。
永丰仓。
八儿思秃仓，大德元年（1297年）七月隶于上都留守司。
永备仓。
察罕脑儿米储仓。
平准行用库。①（参见叶新民：《元上都的官署》，载《内蒙古大学学报》，1983（1））
上都留守司的官员设置，从元世祖到元泰定帝朝迭经变化，至元文宗时才基本确定下来。
元代重要的中央机构，在上都都设有分衙或下属官署。这些官署一部分是为了随行皇帝到上都驻夏大臣处理政务所设，如中书省、枢密院、御史台、大司农司、翰林国史院、集贤院、宣政院、宣徽院等分衙和官署。另一部分则长期分管上都路的课税、事产及在路内居住的各斡耳朵、各投下人户及站户、人匠等事务，大致可以分为四种：
掌管上都课税、事产的，有户部所属上都转运司、上都群牧都转运使司（设于至元二十一年）、上都事产提举司、上都银冶提举司（设于至大三年），工部所属上都毡局、云州、宣德、奉圣州织染司及将作院所属上都金银器盒局（设于至元十六年）等官署。
管理上都境内国家工匠的，除上述工部诸局人匠总管府属下局司外，还有翊正司所属管领上都等处诸色人匠提举司，随路诸色人匠都总管府所属上都诸色民匠提举司及各杂造局所，管领上都、大都诸色人匠纳绵户提举司所属上都人匠局，武备寺所属上都甲匠提举司、杂造局、奉圣州军器局和蔚州、宣德军器人匠提举司等官署。
管理上都路内蒙古站户的，是通政院分衙上都通政院，设于至大四年（1311年）闰七月，原定为正二品，后降为从二品官署。汉人站户则由兵部分衙掌管。
管领诸斡耳朵、诸投下怯怜口人匠的，有管领怯怜口诸色民匠都总管府所属管领上都怯怜口诸色人匠提举司，管领诸路怯怜口民匠都总管府所属上都管民提领所、怯怜口毛子局，怯怜口诸色民匠达鲁花赤并管领上都纳绵提举司及其所属上都人匠提领所，长信寺怯怜口诸色人匠提举司所属上都铁局，等等。
上述官署既与上都留守司的下属机构并置，又大多自成系统。在上都路内设置如此复杂的官府体系，似乎是凡事必有所司，实际上权力分散，极不易进行全面管理。
三、上都驻防的军队
为保证上都及其周围地区的安全，除每年派大批军队在山前、山后及上都周围驻夏外，元朝政府还设置了专门的军事机构，管理在上都路内长期驻防的军队。
按照元朝的军事制度，“郡邑镇戍士卒，皆更相易置，故每岁以他郡兵戍上都”①（《元史》卷九九，《兵志二·镇戍》）。中统年间和至元初年，上都的驻防军大多来自在辽西的北京都元帅阿海所部军和中原诸汉军万户所部军。②（参见《元史》卷四、五，《世祖纪一、二》）以后，则以隆兴路、西京路的军队与西川的军队易地而戍，“上都屯戍士卒，其奥鲁（原义老小营，即军人家属，管理军人家属的机构后来也称奥鲁———引者）皆在西川，而戍西川者，多隆兴、西京军士，每岁转饷，不胜劳费”，“军士疲于转输”③（《元史》卷九九，《兵志二·镇戍》）。为了解决这一矛盾，至元十二年（1275年）时在两都及平滦路猎户中新签军两千人。至元十四年（1276年）正月，又发出诏旨，命令“上都、隆兴、西京、北京四路编民捕猎等户，签选丁壮军二千人，防守上都”，中书省遂作出具体规定，“从各路搭配，二十五户内取军一名，选善骑射者充，官给行资中统钞一锭，仍自备鞍马衣装器仗，编立牌甲，差官部领，前来赴役”④（《元史》卷九，《世祖纪六》：卷九八，《兵志一·军制》）。这一支军队入役以后，第二年（1277年）七月，即“复上都守城军二千人为民”⑤（《元史》卷一〇，《世祖纪七》），所复（免役）军人大多应是长期贫乏难以继续应役的人。
至元十六年（1279年）四月，又作出了新的规定，“定上都戍卒用本路元籍军士”，以上都民充军者四千人卫戍都城，“凡他所来戍者皆遣归”⑥（《元史》卷一〇，《世祖纪七》：卷九九，《兵志二·镇戍》）。实际上直到至元十九年（1282年）七月，才将西川在上都的戍军和隆兴、西京两路在西川的戍军对换过来，各守近地。
至元十六年（1279年）确定上都镇戍军定名为虎贲军。次年（1280年），置立都指挥使二员，副都指挥使二员，罢去了原来上都军队的奥鲁官，“以留守司兼管奥鲁事”。大德元年（1297年）年初，正式设立虎贲亲军都指挥使司，“管领上都路元籍军人，兼奥鲁之事”⑦（《元史》卷八六，《百官志二》：卷一一，《世祖纪八》）。在松州，还设置了虎贲分司。⑧（参见《国朝文类》卷四一，《经世大典序录·屯田》。贡师泰曾在至正十一年（1274年）七月巡按松州虎贲分司（《玩斋集》卷五），可知该司不是一个临时机构，但始设时间不详）元朝规定，军队百户分为上、下两等，上百户统军七十人，下百户统军五十人。虎贲卫共设百户二百员，士兵总额大致在一万人至一万四千人之间。
虎贲军在上都驻防，家属就在路内，不需要长途转运军需装备，但要经营屯田以解决粮草问题。至元十七年（1280年）二月，御史大夫玉昔帖木儿建议在上都路内原来建有驿站之处设立屯田。至元二十八年（1291年）二月，“以上都虎贲士二千人屯田，官给牛具农器，用钞二万锭”。次年（1292年）十一月，枢密院认为“上都屯田二年有成，拟增军千人”①（《元史》卷一六、一七，《世祖纪一三、一四》：卷一〇〇，《兵志三·屯田》），遂立三十四处屯田，役军士三千人，佃户七十九个，共计有田四千二百零二顷七十九亩。
至元二十二年（1285年）二月，将镇戍长江、淮水沿岸及在江南的镇戍军队分编为三十七翼万户府，其中有上都新军下万户府的建置②（参见《元史》卷一三，《世祖纪一〇》），当是由上都军人南下镇戍者组成。这一统军机构并不设在上都。
在上都路内，还有一些蒙古军，分属于各斡耳朵、诸王和贵族，也应有朝廷直接控制的一部分蒙古千户，但其情况已难确知。
四、上都留守司官员的任用
掌管上都路行政管理的留守司，因关系到皇帝及朝廷中枢机构近半年的活动，责任重大，它的官员配置和选用，自然要引起朝廷的高度重视。
忽必烈最早任命的行政官，是开平府达鲁花赤兀良吉带（兀良合带），总管是忙古都、董铨，同知是阿合马。阿合马为回回人，以善于理财而得到忽必烈的信任，他以同知兼太仓使。其他两人的情况不详。③（参见《元史》卷五，《世祖纪二》：卷二〇五，《阿合马传》。王恽：《秋涧先生大全文集》卷八一，《中堂事记中》）
开平府升为上都路总管府后，兀良吉带仍担任了十多年的达鲁花赤。至元七年（1270年）七月，“命达鲁花赤兀良吉带给上都扈从畋猎粮”①（《元史》卷七、九、一一，《世祖纪四、六、八》），至元十三年（1276年）正月，设立通政院，以兀良吉带管领该署，负责往和林运粮和管理蒙古站户。至元十八年（1281年）时兀良吉带仍在职。董铨为上都路总管兼开平府尹，阿合马仍为同知。至元元年（1264年）十一月，擢升阿合马为中书平章政事，继任同知的是汉人张焕。②（参见《元史》卷五、八，《世祖纪二、五》）
正式设立上都留守司后，“大驾岁巡幸，中外百官咸从，而宗王藩戚之期会朝集，冠盖相望，供亿之计，一统之留守，故为职最要焉”③（虞集：《道园学古录》卷一八，《贺丞相墓志铭》）。元朝选用官员，一重民族，“台省要官皆北人为之，汉人、南人万中无一二”④（叶子奇：《草木子》卷三上，《克谨篇》）：二重门第出身，即所谓“根脚”，皇帝的怯薛、先朝功臣，都被视为“好根脚”。上都留守的选用，当然更要彻底贯彻这两条原则。
忽必烈建立的元王朝，虽曾“效行汉法”，任用了一批汉人官吏，可仍然是以蒙古统治阶级为主体，“仕途自木华黎王等四怯薛大根脚出身分任省台外，其余多是吏员”①（叶子奇：《草木子》卷四下，《杂俎篇》）。大蒙古国时期的蒙古功臣世家，入元后仍享有政治特权。作为五投下之首的木华黎家族，世袭国王爵位，世掌朝廷第三怯薛，可以说是当时能够左右朝政的蒙古显贵家族。该族的草原封地，就在上都路东邻的辽阳，管理上都的重任，理所当然要交给皇帝最信任的这个蒙古家族的成员。贺仁杰之父贺贲，在忽必烈率军征大理时，献金助军费，并荐贺仁杰入为怯薛。贺仁杰以勤劳侍奉得到了忽必烈的宠信，被委以留守要职。其子贺胜以后又有象辇前救驾的功劳，更为贺家世任留守要职奠定了基础。元中期以后，色目人在朝中的地位不断提高，色目人出任上都留守的逐渐多了起来，两家世掌要职的传统也受到了冲击。