七月十六日上午九时，蒋介石在梅花村三十二号召开国民党中央常会。特邀李宗仁、阎锡山参加。蒋在会上说：美国政府已对我们采取旁观态度，吾人不能静候此种情势的自然发展。我以为如果一些东亚国家能够结成一个反共同盟，共同对美国提出呼吁，则美国态度终有改变的希望。因此，我特于本月十日从台北飞往菲律宾的夏都碧瑶，对菲律宾进行三日的访问。在此期间，我同季里诺总统对上述问题充分地交换了意见，结果发表了一个联合宣言，主张与其他东亚国家共同努力以求其实现。蒋随即命黄少谷把那个所谓联合宣言当众念了一遍。其后蒋又把一个决议请李宗仁朗读。决议指出：常会对蒋总裁访菲之行给予高度的评价，对联合宣言精神一致表示支持。蒋所以如此，是要对大家表明：蒋、李团结一致，共维危局。
休息后，常会继续开会。蒋提出了中央非常委员会组织条例。蒋说，设置中央非常委员会，是我于四月二十二日同李代总统在杭州会谈时所决定的。其目的在加强党与政府的联系，并使其成为党的最高决策机构。大家对此均无异议。蒋又说，依据组织条例的规定，中央非常委员会主席、副主席，由本党总裁和李代总统担任，现提议推居正、于右任、何应钦、张群、阎锡山、吴铁城、朱家骅、吴忠信、陈立夫为委员，洪兰友、程思远为正副秘书长。均无异议通过。李宗仁认为所谓“非常委员会”的组织，“这完全是蒋先生为加强对党政军的直接控制，而特地设置的叠床架屋的机构。数月以来，他在幕后的非法操纵已加速了政治、军事、财政的崩溃；如今他再利用此制，尤将使大局从速崩溃。我对蒋此举深觉痛心，然而顾全大局，未便与蒋先生公开龃龉，隐忍了事。但是副秘书长程思远却万分消极，他参加了一两次会议之后，便去香港居住了”。（李宗仁：《从南京出走到飞往美国》，载《广西文史资料选辑》，第八辑，第四十三至四十四页。）
下午四时，蒋介石又召开“中央非常委员会”第一次会议，阎锡山提出了《扭转时局案》，内分政治、军事、经济、文化各项目，洋洋数万言，印成一大本。吴铁城说：原文太长，无从审议，应由行政院分发各有关部门拟订实施办法，再提会讨论。
其后蒋提出成立“中央非常委员会”西南、东南两个分会，以张群为西南分会主席，陈诚为东南分会主席。同时蒋又提请任命陈诚为东南军政长官，直辖闽、浙、台湾、广东、海南岛等地区。张群对四川军政局势，表示悲观，当场请蒋准予免任西南军政长官和“非常委员会”西南分会主席两职。但蒋仍要他勉为其难。
七月十八日，继续开会，讨论蒋提出的《党务改造方案》。蒋说：国民党的改造是一个根本措施，必须党改造得好，才能刷新政治、发展经济、加强军事。继命张道藩、谷正纲就这方案的主要内容及其基本精神加以说明。蒋说，常会对此方案，不要作出决议，因为以后还要继续研究。各人如有意见，可用书面提出。（一九五〇年七月二十二日，在台北的国民党中央常务委员会通过《中国国民党改造案》，遂于二十六日发表陈诚、张其昀、张道藩、谷正纲、郑彦芬、陈雪屏、胡健中、袁守谦、崔书琹、谷凤翔、曾虚白、蒋经国、肖自诚、沈昌焕、郭澄、连震东等十六人为中国国民党中央改造委员。）
七月十九日，美国驻广州使馆代办路易士？克拉克要求见蒋，问他访问菲律宾的真正意图。蒋直告克拉克说：“因美国不肯积极负起领导远东之责任，我等不得不自动起而联盟耳。”（蒋经国：《负重致远》，第二O八页。）
二十一日凌晨，蒋邀李宗仁到梅花村话别。上午八时三十分，由黄埔乘华联轮离开了广州，二十二日抵厦门，住鼓浪屿的黄奕柱寓所。