1696年，噶尔丹兵败，康熙皇帝从战俘的口中得知，五世达赖喇嘛竟然已经圆寂了15年之久；而这一切，第巴桑杰嘉措从来就没上奏过，而且还明目张胆地用五世达赖喇嘛的名义发号施令。
盛怒之下，康熙皇帝下旨严厉地训斥了桑杰嘉措，在旨意中说：“如果再不据实上奏、阳奉阴违，就像平定噶尔丹一样铲除了你。”
桑杰嘉措慌了，他连忙对康熙皇帝坦白，匿丧的事情是遵照五世达赖喇嘛的遗嘱办理的，灵童早已经找到，并一直在受正规的教育，但是占卜的结果是不便对外公开。鉴于现在的情况和最新一次占卜的结果，我们会立刻将灵童迎请到拉萨来，请皇帝陛下批准他坐床。
1697年4月，在措那居住了十年的小灵童，已经成长为15岁的青年，此时，他要启程到拉萨去，成为藏民的宗教领袖。
虽然他的身份马上就要公开，但是为了安全考虑，桑杰嘉措只对一部分人说明了其中的原委，等护送小灵童的队伍走到浪卡子的时候，他们停住了。8月份，桑杰嘉措终于对全藏公开了五世达赖喇嘛已经圆寂、转世灵童马上就要迎请而来的消息。
可是，这位灵童与其他活佛不一样，他已经15岁了，一系列原本应该完成的宗教“手续”，一样都没有进行过，比如，他现在还没有出家呢。很快，五世班禅大师受邀来到浪卡子，给灵童授了沙弥戒，并给他取了法名，叫仓央嘉措。
仅仅一个月后，仓央嘉措就在布达拉宫举行了坐床典礼。康熙皇帝认可了桑杰嘉措的说法，没有对灵童进行“考察”，而是很顺利地给予册封，并派章嘉国师亲自出席坐床仪式，颁发册文。
从此，这位秘密地在格鲁派和桑杰嘉措保护下生活了十几年的孩子，成为了西藏第六世达赖喇嘛。
因为此前教授他的老师，只不过是名义上的，此时，他的学习生涯中有了正式的师父五世班禅大师。
班禅大师给他上的“第一堂课”，传授的内容并不是佛法，而是希望——他对仓央嘉措讲述了五世达赖喇嘛一生的故事，最后对他说：“前世大师一生鞠躬尽瘁，作为转世尊者，你也要像他一样勤奋勤勉。”
仓央嘉措望着师父，重重地点了点头。他突然发现，此前的老师只不过教会了他一些知识，而面前的这位真正的老师却像父亲一样：他不是板着面孔严格教导的教书人，而是在他的心中开启了一扇门。这扇门一打开，他仿佛看到了一条光明的大路——是啊，做人，就要做像前世那样伟大的人。
从第二年开始，仓央嘉措开始学习更多的经典，他的老师都是各教派的著名学者，而他的第巴、精通多种学问的桑杰嘉措，也亲自教他一些学问。
然而，第巴实在太忙了。作为格鲁派甘丹颇章政权的实际领导人，他心中最清楚，此时的他需要做什么。
那是五世达赖喇嘛的遗愿，那是为了西藏的长治久安而必须完成的任务，那是他想要送给仓央嘉措最厚重的礼物。
再过几年，仓央嘉措成人后，他要独立挑起宗教和政务两方面的重担，他哪里负担得起？所以，自己必须为他创造好一切条件，让他顺顺当当地亲政，做一位万人敬仰的活佛，这，才对得起五世达赖喇嘛的厚恩。
虽然此时自己内外交困，但是，看见这位健康、聪明的年轻人，桑杰嘉措实在不忍心让他过早地参与政务。他十分清楚，这是一潭浑水，为了别让仓央嘉措惹上麻烦，为了让他好好地长大，哪怕前面是万丈深渊，自己也得一个人跳下去。
而这，也是五世达赖喇嘛临终前交给他的任务，他必须完成，不能拖到仓央嘉措成人之后，不能再给这一代活佛增添麻烦。
时间，真的不多了。
为了完成这个任务，已经付出了两代人的心血，五世达赖喇嘛做了几十年，接力棒交给了桑杰嘉措，他又做了十几年，眼看快有起色了，可惜，噶尔丹却横生枝节。
桑杰嘉措看着自己的学生，想到了当年五世达赖喇嘛对自己是如何悉心教诲的，他仿佛看到了十几年来老人每一次对政教大事做决定时，都会问一问他的意见，如果他的办法成熟稳妥，老人都欣慰地点头。就这样一次次地耐心栽培，十多年后，老人终于将自己的计划合盘托出。
早在五世达赖喇嘛还年轻的时代，格鲁派遇到了一次生死存亡的危机。当时，蒙古喀尔喀部的却图汗、噶玛噶举政权的藏巴汗和康区的白利土司结成同盟的，立誓要消灭格鲁派。五世达赖喇嘛默许了索南热丹的建议，请来了蒙古和硕特部的固始汗，用武力铲除了敌对势力。本来，他是想与和硕特部结成同盟，没想到，和硕特蒙古人来到西藏后，便羁留在此，虽然帮助格鲁派建立了甘丹颇章政权，却处处把持大权。
这是颗1642年埋伏的定时炸弹，至此，已经长达五十年了。五世达赖喇嘛心中清楚，合作初期都是愉快的，但天下没有不散的筵席，如果和硕特蒙古人与格鲁派有一天失和，格鲁派的命运还是操纵在蒙古人的手中。
桑杰嘉措理解五世达赖喇嘛的良苦用心，他一心培养、扶持噶尔丹，就是希望他的准噶尔部能够成为更远、更强大的同盟军。而在固始汗去世后，他又成功地将和硕特部分为两部，一部是留在西藏的势力，是要紧密提防的；一部是留在青海的势力，是要结成盟好的。当两股势力无法继续合作的时候，就是格鲁派安全的时候。
下一步棋，也是五世达赖喇嘛一直没有走完的棋，就是将以前赋予和硕特部西藏势力的大权，一点一点地收回到格鲁派的手中。最关键的一点，就是第巴这个位高权重的职位，绝不能由蒙古人任命，更不能老迈昏聩、无所作为，它只能由最有才干也最为忠心的人来担任。
想到这里，桑杰嘉措仿佛又听到了五世达赖喇嘛的临终嘱托。他明白，老人当年苦口婆心地请求他担任第巴，就是为了在小灵童成人前稳住局势，别让他一生的辛苦付诸东流。
这步五世达赖喇嘛没有走完的棋，他怎么能够不继续走下去？让他略感欣慰的是，固始汗去世后，他的儿子、孙子都没有什么才干，虽然住在拉萨，但对政务并不怎么插手。许，再过两三代，这颗定时炸弹的威力就会消失，西藏的地方政教事务大权，就可以完全回到自己人的手中。
可他没想到的是，此时他的远方同盟军——噶尔丹竟然倒台了，连带着将他拉下了水，那个更远处的、更强大的“施主”清政府，对他也产生了不满，多少年的苦心经营，险些被噶尔丹完全葬送。
看着仓央嘉措的脸庞，桑杰嘉措百感交集，他多想这个孩子快些长大，做一个意志坚刚、万众服膺的领袖，但是，他又多想让他迟些亲政，因为，前面有很多看不到的危险，这个孩子还太嫩，威望还太低，所有的风险，哪怕是刀光剑影，都由自己担着吧。
然而，桑杰嘉措想错了。
在他给仓央嘉措设计的规划中，迅速成长的方式就是加紧学习，早日做一位宗教方面的大成就者，而迟些亲政的目的也是加紧学习，为他成为一位佛学精湛的大师打下坚实的基础，只有成为这样的宗教权威，他亲政后才会受到拥戴，他的政令才会顺利执行。桑杰嘉措恨不得他立刻通晓显密经典，不仅给他选派了各派的大学者当老师，而且有空的时候，自己也亲自教授。
可他万万想不到的是，此时的仓央嘉措，对宗教学习已经没有了兴趣。
来到布达拉宫之后，仓央嘉措发现自己过着与以往完全不同的生活：身边的侍从依然那样恭谨，神色中却不再将他当做那位措那的孩子；师父们依然那样严肃认真，却不会再像以往循循善诱，声色中多了些许严厉；他要莫名其妙地接见很多陌生人，虽然这些人见到他满心欢喜，他却要说些自己都觉得别扭的客气话；而那些本来比较熟悉的人，此时都行色匆匆，开口闭口不是政务就是税收，要不然就扯到遥远的蒙古或者中原，很多次他想详细地了解些什么，他们却遮遮掩掩，好似不愿意跟他说……
这样的日子，还有什么意思呢？
如果不能与自己的臣民心无芥蒂地交流，这样的领袖还不如不做。
难道，达赖喇嘛都是这样长大的吗？他渐渐回忆起自己的前世、五世达赖喇嘛的过去。他清楚地记得，五世班禅师父给他上的第一堂课中，就讲述了五世达赖喇嘛一生的功绩，在16岁的时候，他老人家已经参与政教事务了。可此时，没人愿意跟自己谈这些，每天的谈话，都是努力学习、弘扬佛法之类的话，让他都听烦了。
仓央嘉措感到很失望，也很委屈。他清楚自己年纪小，那些政务是做不来的，可他现在只不过是想了解一下身边的人都在忙些什么，并没有想给臣下们出主意，可就是这么简单的事情，他们也不屑于跟一个孩子说。
既然这样，自己每天学这么多经典，长大了又有什么用处呢？难道开口闭口都是经文，这样就能治理好脚下的土地？
从此，仓央嘉措不再努力学习佛学。他心中清楚，要想做一位像五世达赖喇嘛那样卓越的政治家，他眼下的这些师父们，是没有人能教他什么真东西的。
他的这种学习态度很让桑杰嘉措惊讶和不安。很快，他听到身边的人汇报，活佛不喜欢学习，经常出游，生活上也很懒散。桑杰嘉措的心痛了，他暗暗地叫苦：孩子，你这样做，枉费了我十几年的心血啊。
他马上提笔给五世班禅大师写信求助：大师，这孩子最近不甚喜爱佛学，时常倦怠懒散，而又听人说他喜好游乐，对此我深为担心。然而我俗务甚多，终日忙碌，深恐放纵了他，此次修书，请大师多加教规训导，以免遗恨。
五世班禅大师接到信后，派人告诉第巴，说，按照以前的约定，马上要给仓央嘉措授比丘戒了，受了戒的人，精神必会振奋，身心自然清净，会有一个良好的改变。至于年轻人喜好交游，也属正常，勿需担忧，到时他自会与仓央嘉措深谈，端正其心。
桑杰嘉措只好把全部希望寄托在五世班禅大师身上了，此时的他，已经无力分身。
自从强大外援噶尔丹死后，准噶尔大权落在了他的侄子策旺阿拉布坦手中。桑杰嘉措本以为可以与他结好，延续格鲁派与准噶尔之间的良好关系，维持住五世达赖喇嘛生前创造的局面。可恨的是，这个策旺阿拉布坦跟他叔叔噶尔丹简直是两路人，他多次上书给康熙皇帝，处处说桑杰嘉措的坏话。
桑杰嘉措明白，策旺阿拉布坦肯定没怀好心，他想扳倒自己，进而一举挺进西藏。然而，他只能哑巴吃黄连，康熙皇帝对他早已经不满，此时他再辩解什么又有什么用呢？
让桑杰嘉措心中更没底的是，1701年，硕特蒙古的头领达赖汗，这位在世时基本不插手格鲁派政务的大汗去世了。桑杰嘉措的内心很矛盾，他多少有些惋惜，因为达赖汗是个不管事的甩手掌柜，有这样一个人做大汗，自己的一系列政策都能顺利地推行下去；桑杰嘉措很快又觉得欣喜，每一次汗位交替都是难得的政治时机，如果此后接替汗位的是个更庸碌的人，自己便可以大张旗鼓地收回更多的权力，五世达赖喇嘛的遗愿便可以更快地完成了。
可是，接任大汗的是谁呢？桑杰嘉措暗暗观察着达赖汗的儿子们：大儿子旺札勒最有可能，他也真是个符合自己心中所想的人选，而他的弟弟呢？其中可有个心狠手辣、傲慢狡猾的人。不过，桑杰嘉措很快放下心来，他心目中最适合的人选旺札勒果然顺利地当上了大汗。
现在，桑杰嘉措最不放心的，就是仓央嘉措了。这位日渐长大的活佛已经不是当年那个听话的孩子了，他好像对很多事情都有自己的想法，不再顺从老师们的话。桑杰嘉措将所有希望寄托在1702年，因为在这一年，五世班禅大师就要给他授比丘戒，从此，他就将成为正式的僧人。
人这一生很奇怪，再顽劣的孩子，当他意识到自己是一个真正的成年人时，往往都会瞬间长大。桑杰嘉措寄希望于受了戒的仓央嘉措会从此改掉懒散的毛病，用功学习，然而，他又一次想错了。
6月的这一天，格鲁派的高僧们护送仓央嘉措来到日喀则的札什伦布寺。五世班禅大师见到他，十分欣喜，请他为全寺的僧人讲经，可让大师想不到的是，仓央嘉措拒绝了。