（一）清朝前期康熙至乾隆时间创建的书院
康熙时期新建的锦江书院、乾隆时期重建的明代潜溪书院都是由官府倡建，名儒主办，其发展也受到地方政府的大力扶持。
锦江书院是清代成都享有盛名的书院，在成都诸书院、学校中影响最大，历时最久，院址也几无变化，一直位于文庙附近，长期以来作为四川地区最高学府，"为通省作育人材之所"。其师资和毕业生质量较高，"为全川书院之首，规制崇宏，它无与比，名师较多，人才辈出"。学生来源，出于全省内挑选的秀才以上的生员，而无秀才、举人以上资格者，都不得入学。
锦江书院建于康熙四十三年(1704)，四川按察使刘德芳，为振兴蜀学，培植人才，在文翁石室遗址上、成都府学之旁，重建讲堂斋舍，取名锦江书院。时"巡抚都御史贝公莅蜀三载，镇蛮既平，公亟欲兴文教以植人材"。除按察使刘德芳捐俸金外，成都县令田轩来，温江县令邱君璋董其役。锦江书院的学生名额，初时，正课五十人，附课五十人，外课视成绩和正、附课人员名额盈缺而定，约二十人，是候补性质。正课月给米一斗五升，银一两五钱；附课生减半；外课生没有津贴和照顾。
康熙六十年(1721)，锦江书院的规模有所扩大。四川提学使方觐，又增修了讲堂学舍，招生名额也有所增加和扩大。雍正十一年(1733)，清政府下令京师设金台书院，各省省城设立书院一至二所。包括四川锦江书院在内，全国共设立书院廿二所，确定了这些书院是省立的地位，学生生活费，一律由清政府拔给学田供给。乾隆三十九年(1774)，四川总督文绶，布政使钱鋆等，又扩大增修书院讲堂，并增置学田地产，作为学生的学习津贴之用。因此，锦江书院的办学经费是比较充裕的。嘉庆二十四年(1819)川督蒋攸铦整顿书院，制订《锦江书院条规十条》，加强书院管理和诸生考核。道光二十八年(1848)学生达到150人。咸丰七年(1857)正附课学生达148人，加上外课学生总数在200人左右。
锦江书院在文翁石室旧址，成都府学侧的建立，使清代成都的文庙地带进一步成为文教区。从嘉庆《华阳县志》所载的"锦江书院图"来看：书院门外庄肃，有照壁，门亦为八字门。书院内部布局极为规整，整体上分为前后四个院落，功能上亦有所区分，内部建筑物更为多样化，既讲究中轴线对称，又通过偏院和奎星阁、后园使得内部环境显得错落有致。前三个院落为学子问学修习之地及教习寓所，在中轴线上设门厅、大堂、牌坊、三公堂、讲堂、还有东廨、西圃；后园为秀丽的奎星阁及后花园，学子斋舍在中轴线两侧的偏院中，三公堂为后院之中心建筑，其内正中设道统神主，两侧为正学、理学名臣神主。讲堂两侧为掌学斋舍，以封建尊卑观念而言，"讲学名公"位尊，居于中间，学子位卑，居于甬道两侧偏院。
锦江书院内环境优美，就环境建设而言，书院内有假山、树木、亭、桥、井等，构织了一幅小桥流水的美妙画卷。书院不但环境优美，设施完善，而且能吸引延聘到当时的名士前往讲学，学者彭端淑、高白云、姜尔常、敬华南、易简、杨锡麟、李惺、顾汝修等均先后掌院执教讲席。光绪二十七年(1902)，在全国废书院、兴学堂的背景下，四川总督岑春煊宣布结束锦江书院，财产归高等学堂，院址校舍并入成都府中学堂，即石室中学。
潜溪书院，创设于乾隆十二年(1747)，院址在成都外东五养乡，外东净居寺，书院后有明初文学家宋濂之墓，侧立二贤祠，祀宋儒赵抃、明儒方孝儒。为纪念宋濂，书院定名潜溪。明代潜溪书院有祀田八百亩，乱后无主，为净居寺寺僧侵占者百有余年，清乾隆十二年(1747)，华阳县令安洪德，作育人才，鉴于虽有锦江书院创立于前，而士子求学者甚众，于是查核档案册籍、清理静居寺僧侵占祠舍、田产，促其归还，请予政府立案，设潜溪书院于此。"延名师，设讲席，集生徒，朝夕肆业于其中"，"一时负笈者户外之履满焉"。
从嘉庆《华阳县志》所载书院图上来看：潜溪书院与净居寺比邻而居，中有二贤祠相隔，书院小巧精致，院门前有虹桥跨溪而过，门旁设有二华表，整个书院有三重院落，第一进门厅设有清风亭，第二进中堂为讲堂，第三进为讲师习所，二三进院落两侧厢房为学舍，后园有宋濂之墓。道光十三年(1874)，华阳知县高学濂，以潜溪书院距城五里，每值阴雨道路泥泞，官府主徒行住不便，募资购梨花街屋宇，改建讲堂，把师生迁入新址读书。
（二）嘉庆后成都书院建设
嘉庆道光年间之后，成都创建了许多书院，此时科举为进身之阶，日益受到恢复后的地方社会的关注，成都书院也相应增多了。除地方官吏外，一些士绅加入到书院建设之中，显示了地方社会对国家教化象征的认同和趋附。
芙蓉书院，创建于嘉庆六年(1801)，清成都知县张人龙比较重视教育，认为"化民须先隆学校，教士应首重师儒"，自捐银二百两，集绅耆募资七千余金，与县儒学教谕王子诏一起筹办，在成都北署袜街拐枣树购民房一所，今帘官公所街省建一公司。扩而新之，建立了成都芙蓉书院。
书院颇具规模，"自门而庭，而讲堂，而山长书斋，诸生书院，共卅余间"。并置买水田二百余亩，"为修脯膏火之资"。芙蓉书院办学有条理，其课程设置也是课经史时艺，但要求严格，"与锦江潜溪遥相辉映"。咸丰三年（1853），经过一些周折，改迁于青龙街墨池书院间壁，有大门、二门、讲堂五间、过厅五间、诸生书舍三十四室、山长寝室五间。拐枣树原芙蓉书院改为帘官公所。
墨池书院，道光元年(1821)创建于汉代扬雄故里，学政聂铣敏游览"子云洗墨池"，怀念故人，"遂生办学之念"，除自己捐俸，并集资购买前剑南道郑氏私宅，"绵亘三院，内屋二百余间，外空地四亩，后为洗墨池"。把中院作为墨池书院，左为东园，右为廉泉精舍。经过增修补葺，房舍作为讲堂、学舍，其余亭榭作为游览之所，园圃有蔬菜之利，"较之锦江(书院)规模又有别焉"。建立墨池书院是"以补锦江书院之不足"，"继文翁之兴学，复子云之遗迹"。墨池书院的环境比较幽静，空地较多，花木繁茂，"墨池者既有键户下惟之地，又有赏玩之趣，学者藏修息游地，以共讲所闻，则墨池为最也"。这是一个优美的读书地方。
墨池书院在温江白家碾购有学田七十余亩，房屋较多，前后园租、铺税亦丰，供修脯膏火颇足。道光元年以后，学生参加两科考试，多人中试，办学效果比较显著。大约在聂铣敏离任后的一段时间，墨池书院曾一度衰落，"奈事无专主，不肖之辈人破坏之，各种什物、图书，大量失散，房舍、亭榭日益剥落倒塌"。道光十三年(1833)，聂铣敏之子聂有湖、聂有翰派人来川，将房契交县，作为公所，什物、舍宇值万金，以后书院经费日绌，"书院日益衰落，向之月榭风亭渐煤盿荒烟蔓草，向之净几明窗，今且破瓦颓怀矣"。
咸丰二年(1852)，地方官准备把帘官公所迁到墨池书院，地方人士反复要求，愿意将原芙蓉书院地址作公所，墨池多余之地为芙蓉书院。经批准，芙蓉书院从拐枣树迁入墨池书院，中间划墙，右为芙蓉书院，左为墨池书院，外仍悬墨池书院匾额，中留一堂为聂公祠(聂铣敏祀祠)。学使何绍基将公所迁往拐枣树芙蓉书院原址，为帘官公所。"墨池书院之名不废，芙蓉书院在于其右"。
元音书院创建于嘉庆十二年(1807)，在华阳县治东三十里，旧慈音寺，寺僧不肖，成都知府张敏树把寺僧驱遂，改为书院，有田二十余亩，岁入租以为膏火学习津贴。
尊经书院由士绅创办，同治十三年(1874)四月，洋务派官僚、工部侍郎、丁忧在籍的本省兴文人薛焕，联络官绅十五人，上书四川总督吴棠和四川提督学政张之洞，提出当时的省城锦江书院，主要以学习制艺八股文为目标，不符合时代要求，请求再创办一所书院，以便继承文翁之教，培养人才，以"通经学古课蜀士"，定名为尊经书院。薛焕等人的请求，得到清廷批准后，筹款购地，在省城南门石犀寺附近，即南较场，修建尊经书院。学生来源是由省内各府按比例在秀才、贡生等资格的人员中选送。由于经费来源流裕，除了拔盐税公款的盈余外，还有数百亩学田，学生不交学费，还规定每个生员领"膏火"银子四两。